More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1270 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1270  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
421 aa  848    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2725  transcriptional regulator, LuxR family  36.58 
 
 
431 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  33.41 
 
 
758 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.5 
 
 
981 aa  102  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  44.74 
 
 
940 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  37.88 
 
 
919 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  37.72 
 
 
894 aa  63.9  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  33.97 
 
 
893 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  44.16 
 
 
930 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  50.75 
 
 
927 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
881 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
881 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 
947 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
876 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
889 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  42.2 
 
 
894 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  39.36 
 
 
913 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
937 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  41.41 
 
 
904 aa  61.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  38.89 
 
 
937 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  38.89 
 
 
937 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 
993 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.33 
 
 
923 aa  60.1  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 
973 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 
1104 aa  59.7  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  39.56 
 
 
925 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02400  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.06 
 
 
255 aa  59.7  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  35.26 
 
 
974 aa  59.7  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 
916 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  34.67 
 
 
955 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  34.23 
 
 
920 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 
204 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 
203 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 
951 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  38.61 
 
 
913 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  54.72 
 
 
359 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 
918 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  37 
 
 
867 aa  57.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 
232 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  35.83 
 
 
910 aa  57.4  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  32.16 
 
 
928 aa  57.4  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  41.43 
 
 
963 aa  57  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  38.68 
 
 
937 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  38.04 
 
 
189 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  32.01 
 
 
574 aa  56.6  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 
923 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0187  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.7 
 
 
199 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  39.18 
 
 
928 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 
919 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  35.34 
 
 
940 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  42.59 
 
 
894 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 
208 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4815  transcriptional regulator, LuxR family  34 
 
 
866 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.636863  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  32.71 
 
 
963 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  45.28 
 
 
917 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  43.86 
 
 
936 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0559  transcriptional regulator, LuxR family  35.11 
 
 
788 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  34.52 
 
 
954 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  35.71 
 
 
923 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  38.54 
 
 
938 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  34.44 
 
 
901 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3306  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
238 aa  54.7  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  46.88 
 
 
204 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  44.44 
 
 
892 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 
215 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  30.42 
 
 
1085 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 
909 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
1000 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2716  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 
941 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000419619  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 
903 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  40.98 
 
 
1006 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2358  regulatory protein, LuxR  34.09 
 
 
483 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 
938 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 
1137 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 
905 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  42.37 
 
 
929 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 
953 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.86 
 
 
215 aa  53.5  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 
1022 aa  53.5  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 
995 aa  53.5  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
236 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4851  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  26.63 
 
 
237 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0743346  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 
927 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  40.32 
 
 
943 aa  53.1  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  39.71 
 
 
879 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.69 
 
 
224 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  44 
 
 
119 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  45.1 
 
 
931 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2681  LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
74 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.89 
 
 
211 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 
840 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  33.64 
 
 
567 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  30.63 
 
 
218 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  34.38 
 
 
218 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  43.4 
 
 
913 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2518  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.16 
 
 
225 aa  53.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1565  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.44 
 
 
200 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
368 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  39.39 
 
 
929 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  37.68 
 
 
959 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>