More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2586 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2586  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 223 aa  421  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.646343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1011  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.24 
 
 		 203 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0739  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 204 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.297506  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1210  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04700  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.14 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.162406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6539  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.14 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0365  two component LuxR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.210231  normal  0.243335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4449  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.74 
 
 		 253 aa  115  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3839  regulatory protein, LuxR  37.64 
 
 		 268 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 270 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.78 
 
 		 224 aa  101  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  35.5 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.52 
 
 		 211 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2235  regulatory protein, LuxR  40.67 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  33.71 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.82 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.07 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1088  transcriptional regulator, LuxR family  72.31 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 232 aa  95.5  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.08 
 
 		 253 aa  95.1  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 220 aa  94.7  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.36 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.9 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  32.13 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4314  transcriptional regulator, LuxR family  67.19 
 
 		 132 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  92.4  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.46 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  36 
 
 		 212 aa  92  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  34.23 
 
 		 218 aa  91.7  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.37 
 
 		 210 aa  91.7  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0487  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.43 
 
 		 215 aa  91.7  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4745  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.45 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.85 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.73 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.04 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2342  response regulator receiver  37.43 
 
 		 212 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  30.18 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.23 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  34 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0747  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.13 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.643618  normal  0.38139 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.09 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2658  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.45 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.08 
 
 		 225 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.25 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  37.37 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 207 aa  89  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  28.89 
 
 		 207 aa  89  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 221 aa  88.6  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.27 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2537  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 237 aa  88.6  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 209 aa  88.2  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.56 
 
 		 220 aa  88.2  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 207 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.44 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.5 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  29.38 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.22 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.2 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2088  transcriptional regulator, LuxR family  63.93 
 
 		 135 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.49 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 237 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.04 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.9 
 
 		 212 aa  85.9  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0377  transcriptional regulator, LuxR family  63.93 
 
 		 134 aa  85.9  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  39.04 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  37.11 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  31.08 
 
 		 242 aa  85.1  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 220 aa  85.5  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 215 aa  85.5  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.54 
 
 		 220 aa  85.1  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 250 aa  85.1  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  33.5 
 
 		 209 aa  85.1  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 238 aa  84.7  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.64 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0654  two component LuxR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.639317  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>