More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2409 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_2409  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  564  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2579  LuxR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.286869  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0351  LuxR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637296  normal  0.0151595 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1374  LuxR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1927  LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0238  LuxR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2681  response regulator receiver protein  26.94 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217011  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2048  transcriptional regulator, LuxR family  32.03 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0912162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  43.75 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1874  LuxR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1858  regulatory protein, LuxR  34.78 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.968511  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1895  putative transcription regulator protein  26.27 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.030885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2997  LuxR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.665573 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1505  transcriptional regulator, LuxR family  44.93 
 
 		 522 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  45.12 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2984  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  53.45 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.43543  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3708  LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3869  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02135  putative transcription regulator protein  24.49 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  45.9 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.59 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4299  LuxR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4980  LuxR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00878  two-component response regulator  50 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3180  LuxR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4136  LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 82 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1132  DNA-binding response regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.893152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1857  LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 82 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00288103  normal  0.0218384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1729  LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 82 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00602837  normal  0.265991 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3277  transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1162  two component LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  50 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  57.38 
 
 		 1006 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  50 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  50 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9665  two-component transcriptional regulator LuxR family  49.18 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.024682  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  55 
 
 		 954 aa  62.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1991  ATP-dependent transcription regulator LuxR  51.67 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.141856  hitchhiker  0.00484475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  48.39 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0791  LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0720  LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0182  LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00268604  hitchhiker  0.00000585836 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.79 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_002936  DET1350  LuxR family DNA-binding response regulator  49.18 
 
 		 225 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00111586  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  47.54 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 227 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4359  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1266  DNA-binding transcriptional activator SdiA  36.75 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00315864  hitchhiker  0.00193945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.36 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  46.27 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1547  LuxR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1890  transcriptional regulator LuxR family  34.33 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1655  LuxR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  49.18 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.18 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1715  LuxR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  hitchhiker  0.000116776 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  49.18 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  49.18 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2690  DNA-binding transcriptional activator SdiA  36.75 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.0383701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1869  two component LuxR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2846  two component LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>