More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2579 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2579  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  537  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.286869  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2409  LuxR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1374  LuxR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 267 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0351  LuxR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637296  normal  0.0151595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1927  LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0238  LuxR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2681  response regulator receiver protein  27.89 
 
 		 262 aa  86.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1874  LuxR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.24 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1505  transcriptional regulator, LuxR family  43.66 
 
 		 522 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  36.22 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.53 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 257 aa  62  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2525  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.46 
 
 		 215 aa  62  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.08 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0229  putative metal dependent phosphohydrolase  39.71 
 
 		 474 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05474  transcription regulator protein  48.44 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  31.39 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.68 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  50.82 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1319  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0542522  decreased coverage  0.000972679 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.95 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6457  LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 570 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6692  LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 570 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4360  transcriptional regulator, LuxR family  56.36 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4745  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2601  regulatory protein LuxR  37.93 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1895  putative transcription regulator protein  23 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.030885  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  47.27 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  47.27 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.36 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  51.67 
 
 		 870 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6289  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  47.27 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3326  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  47.27 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2814  LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 146 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.21 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  47.27 
 
 		 200 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03706  hypothetical protein  47.27 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.24 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.56 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4115  response regulator receiver protein  50 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071707  normal  0.0608108 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  47.27 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  47.27 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  45.33 
 
 		 959 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0139  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  39.51 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.89 
 
 		 913 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  47.27 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10861  nitrate/nitrite response transcriptional regulatory protein narL  45.61 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000061441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6094  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634688  normal  0.121163 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  47.27 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3869  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.21 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2814  LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4855  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.093919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3070  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000689776  unclonable  0.00000000000283062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4163  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296115  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1285  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000337392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  49.09 
 
 		 218 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002362  DNA-binding HTH domain-containing protein  47.27 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0501055  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1600  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240626  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3229  two component LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3769  transcriptional regulator, LuxR family  43.84 
 
 		 205 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0158689  normal  0.601222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  39.58 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5412  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 155 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207706  normal  0.221863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3714  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.37 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1241  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000399601  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4220  response regulator receiver protein  46.48 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>