More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4220 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4220  response regulator receiver protein  100 
 
 		 251 aa  509  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0098  transcriptional regulator, LuxR family  46.96 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00697344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0173  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5271  transcriptional regulator, LuxR family  33.52 
 
 		 267 aa  72  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1136  transcriptional regulator, LuxR family  29.7 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1883  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0844  transcriptional regulator, LuxR family  27.13 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0559  two component LuxR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0841173  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.76 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.53 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  36.49 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  54 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.96 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1698  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.02 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1062  transcriptional regulator, LuxR family  34.86 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2387  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132486  normal  0.384012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  41.77 
 
 		 933 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2579  LuxR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.286869  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2103  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2959  salavaricin two-component response regulator  42.62 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681739  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  45 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  45.9 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1440  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.52 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0409  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2895  response regulator of salavaricin regulon  42.62 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0430888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.52 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  47.54 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  45 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  45 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  45 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  45 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2409  LuxR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  45 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4067  two component LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1518.1  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000399536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0560  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0224831  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.49 
 
 		 889 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0851  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464733  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.43 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  45.9 
 
 		 896 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2085  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.844485  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2151  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.639034  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2062  LuxR family DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0947149  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0766  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  39.34 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.56 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4334  two component LuxR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1561  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.62 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0898  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000112877  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 954 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  32.61 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  45.9 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4518  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3102  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.69 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.774177  normal  0.15342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0036  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 221 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0464925  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2437  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5079  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>