More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0173 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0173  response regulator receiver protein  100 
 
 		 256 aa  525  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0098  transcriptional regulator, LuxR family  37.89 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00697344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4220  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 251 aa  142  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5271  transcriptional regulator, LuxR family  29.47 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1136  transcriptional regulator, LuxR family  33.54 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5158  transcriptional regulator, LuxR family  29.24 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00149525  decreased coverage  0.000111139 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4137  regulatory protein LuxR  28.49 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.272227 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0844  transcriptional regulator, LuxR family  29.07 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  43.28 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2655  regulatory protein LuxR  45.9 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.083757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1298  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.08 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.70055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3175  LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4126  transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353041 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3002  LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000242381  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0859  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  46.77 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1062  transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.62 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2798  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.62 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.675669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1686  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.62 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0643903  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  46.97 
 
 		 508 aa  55.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2371  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.62 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440892  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2915  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.62 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2672  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.62 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2729  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.62 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0930619  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1817  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.62 
 
 		 241 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.985291  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4224  regulatory protein LuxR  41.54 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525332  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0409  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 191 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0119  LuxR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 454 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0110  LuxR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.514691  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  47.62 
 
 		 471 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1846  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349565  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2137  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.21 
 
 		 211 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.55 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  44.64 
 
 		 220 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3280  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0930  LuxR family two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.545376  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.9 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0749  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 500 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2103  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 210 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  38.36 
 
 		 229 aa  52.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1558  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 240 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3789  response regulator receiver  33.33 
 
 		 228 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 212 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1733  two component LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 208 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 229 aa  52.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1698  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1418  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.72 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  42.62 
 
 		 917 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 209 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2396  transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 363 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000296074  decreased coverage  0.0001884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4035  two component LuxR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4715  Two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000124934  normal  0.0275678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.26 
 
 		 867 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0139  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  38.75 
 
 		 506 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4554  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376132  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5079  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2962  response regulator receiver  36.84 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5915  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 207 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00974735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2846  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 209 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3030  two component LuxR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1561  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.16 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3572  transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>