More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4137 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4137  regulatory protein LuxR  100 
 
 		 252 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.272227 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2655  regulatory protein LuxR  56.18 
 
 		 251 aa  294  8e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.083757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5158  transcriptional regulator, LuxR family  30.37 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00149525  decreased coverage  0.000111139 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2962  response regulator receiver  39.34 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.43 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0559  two component LuxR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0841173  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2735  response regulator receiver  33.87 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0572845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0173  response regulator receiver protein  28.49 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2103  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.42 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429674  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0844  transcriptional regulator, LuxR family  26.74 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1440  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  38.54 
 
 		 917 aa  58.5  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4278  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.45 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0894003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.96 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  42.62 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  40.85 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1136  transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3241  regulatory protein LuxR  25.38 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  0.0480343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38740  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.83 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3357  two component LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4334  transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  42.62 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.21 
 
 		 889 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  34.74 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2387  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132486  normal  0.384012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1698  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.27 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2437  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34130  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.06 
 
 		 853 aa  55.5  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6962  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2246  two component LuxR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0703025  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  44.26 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0307  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.53 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115356  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3030  two component LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1943  two component LuxR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4439  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.68 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4664  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.94 
 
 		 877 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4684  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  55.56 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.05 
 
 		 309 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1737  regulatory protein LuxR  40.3 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117285  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2137  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  40.58 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.72 
 
 		 867 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  50 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5915  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 207 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00974735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1883  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0659  fimbrial Z protein; signal transducer  46.15 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.379451 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2489  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.56 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.682115 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05830  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.84 
 
 		 238 aa  53.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.388223  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3858  two component LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0335499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1045  regulatory protein LuxR  30.9 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4360  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 381 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.66 
 
 		 222 aa  53.5  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 910 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1298  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 228 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.70055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3277  transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5550  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.1 
 
 		 213 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159917  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 225 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0637  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.71 
 
 		 229 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 216 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 		 214 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3804  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 216 aa  52.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.185264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1558  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3163  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.932633  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  42.62 
 
 		 213 aa  52.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2963  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 219 aa  52.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 238 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3280  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 223 aa  52  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7316  response regulator receiver protein  44.68 
 
 		 201 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2658  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.21 
 
 		 215 aa  52  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  52  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 218 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 208 aa  52  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000124934  normal  0.0275678 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  40.32 
 
 		 567 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  42.11 
 
 		 574 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>