More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2962 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2962  response regulator receiver  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.2 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1698  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4278  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.51 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0894003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2387  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132486  normal  0.384012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2137  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.07 
 
 		 211 aa  168  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1440  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.51 
 
 		 208 aa  157  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000124934  normal  0.0275678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429674  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0559  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0841173  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.54 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.57 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 221 aa  141  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 215 aa  140  9e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 213 aa  138  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.58 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.64 
 
 		 211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12543  Transcriptional regulator  33.01 
 
 		 207 aa  134  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.204025  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2907  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 222 aa  134  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0590247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  37.13 
 
 		 217 aa  134  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  38 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  38 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  35.1 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  35.05 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2055  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0083  two component LuxR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6441  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.26 
 
 		 213 aa  131  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.11 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.11 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6527  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2237  two component LuxR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  36.27 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  33.94 
 
 		 229 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 		 218 aa  128  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 228 aa  128  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 219 aa  127  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 212 aa  127  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2246  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 214 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0703025  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.33 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.58 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.44 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.82 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  33.96 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.31 
 
 		 223 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4664  two component LuxR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  36.5 
 
 		 218 aa  125  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0905  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  34.48 
 
 		 206 aa  124  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0826046  hitchhiker  0.00000533581 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  32.21 
 
 		 219 aa  124  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  33.99 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  32.56 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.53 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2735  response regulator receiver  36.84 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0572845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.39 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 211 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  32.06 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  32.56 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.47 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  35.61 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  32.56 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 216 aa  122  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  32.09 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  32.09 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  32.09 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  32.09 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  32.09 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  33.49 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  33.66 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0443  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.98 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5409  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.45 
 
 		 223 aa  121  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3524  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 214 aa  121  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0390864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 215 aa  121  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>