More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0559 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0559  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0841173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2137  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 211 aa  181  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4278  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.5 
 
 		 213 aa  160  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0894003 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2962  response regulator receiver  36.67 
 
 		 206 aa  146  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.32 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2387  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.63 
 
 		 207 aa  141  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132486  normal  0.384012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1698  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.67 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429674  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1440  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.2 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.66 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000124934  normal  0.0275678 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  31.4 
 
 		 207 aa  118  7.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2907  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.02 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0590247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.14 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.62 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5845  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.9 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  32.71 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  31.25 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  31.25 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  29.68 
 
 		 216 aa  111  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5476  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.68 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.21854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2963  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.23 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4664  two component LuxR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1429  two component LuxR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.85494 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  29.05 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 230 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2103  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.01 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.97 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.97 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.11 
 
 		 222 aa  107  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.5 
 
 		 220 aa  107  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  28.3 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  35.48 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0036  two component LuxR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0464925  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  33 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.69 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.17 
 
 		 236 aa  106  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.96 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0898  two component LuxR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000112877  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  30.48 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  29.25 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.43 
 
 		 224 aa  105  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  28.91 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.19 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2237  two component LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.48 
 
 		 210 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  27.73 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0703  LuxR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000151408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0677  two component LuxR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00533706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  31.88 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.48 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  31.88 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5915  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.19 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00974735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6527  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.29 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.41 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  29.13 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6441  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.11 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  28.71 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0663  two component LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1266  two-component response regulator  32.08 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.847879  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3615  two component LuxR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378192  normal  0.274637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  31.63 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3957  two component LuxR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.721789  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4347  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1667  two component LuxR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3375  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 232 aa  101  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4099  DNA-binding response regulator GacA  28.02 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.427607  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1765  two component LuxR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456405  hitchhiker  0.00257365 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 233 aa  101  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2370  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  29.17 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 219 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0374  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  30.84 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  30.84 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  30.84 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  30.84 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  30.84 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  30.84 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.91 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0443  two component LuxR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>