More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3175 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  100 
 
 		 250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3525  response regulator receiver protein  29.22 
 
 		 274 aa  89.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243537  normal  0.113939 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 264 aa  88.6  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  27.84 
 
 		 247 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  28.02 
 
 		 279 aa  85.9  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  27.84 
 
 		 271 aa  85.1  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  28.15 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  26.34 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  26.13 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  25.87 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  24.21 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  32.34 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  28.88 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  25 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  28.8 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 290 aa  72  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  28.64 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  28.27 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  29.84 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0389  LuxR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2962  response regulator receiver  32.89 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2103  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  34.34 
 
 		 232 aa  62  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  33 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.82 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0747  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.643618  normal  0.38139 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2812  transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 522 aa  60.1  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000674561  hitchhiker  0.0000653029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  47.37 
 
 		 889 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 895 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0108  transcriptional regulator, LuxR family  40.7 
 
 		 493 aa  58.9  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.44109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0287  LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1053  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0211  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11580  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  56.86 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.937657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4096  two component LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.811447  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2437  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  37.8 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00236991  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0180  two component transcriptional regulator, LuxR family  52 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.245465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03730  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.06 
 
 		 426 aa  57  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.532687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0976  transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 501 aa  57  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.018057 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  30.69 
 
 		 574 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0620  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  28.31 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000275655  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0971  transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16732  hitchhiker  0.00115778 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  30.69 
 
 		 567 aa  56.6  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2137  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.65 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2223  transcriptional regulator NarL  48.15 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134159  normal  0.207388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2299  transcriptional regulator NarL  48.15 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.590018  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13650  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  52.94 
 
 		 464 aa  55.8  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0029  two component LuxR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268532  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1053  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.295708  normal  0.0294181 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>