More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000650 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  100 
 
 		 292 aa  613  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  72.89 
 
 		 273 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 267 aa  258  6e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 275 aa  135  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3525  response regulator receiver protein  30.74 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243537  normal  0.113939 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 252 aa  122  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  28.41 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 272 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  26.15 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  27.65 
 
 		 268 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  28.14 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 266 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 298 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 265 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  25.4 
 
 		 284 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 263 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  28.35 
 
 		 267 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 266 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 257 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 275 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 257 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 257 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  26.27 
 
 		 247 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  25.2 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  24.15 
 
 		 275 aa  85.9  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  27.8 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  26.64 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0389  LuxR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  29 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  24.21 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  24.71 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  25.09 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  21.9 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10980  hypothetical protein  26.29 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  47.76 
 
 		 879 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0081  two component LuxR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0565  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.66 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4080  transcriptional regulatory protein UhpA  44.93 
 
 		 196 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4132  two-component system response regulator  44.93 
 
 		 196 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2103  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 		 210 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0132  two component LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.401597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  20.23 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0655  two component LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 194 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2115  transcriptional regulator, LuxR family  26.09 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2158  LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 491 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.78 
 
 		 220 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.62 
 
 		 215 aa  53.5  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  46.55 
 
 		 496 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  53.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 910 aa  53.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  20.78 
 
 		 269 aa  53.1  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1286  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 215 aa  52.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.13459  normal  0.233078 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0642  putative response regulator  42.11 
 
 		 217 aa  52.8  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0810  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.82 
 
 		 223 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0108  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 493 aa  52.8  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.44109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 214 aa  52.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 175 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 950 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 178 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 178 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2443  LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 497 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  36.49 
 
 		 176 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1440  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.34 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5556  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3938  response regulator receiver protein  44.26 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  0.0101023 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 272 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0747  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.06 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.643618  normal  0.38139 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4735  two component LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>