More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3842 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 268 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  97.39 
 
 		 268 aa  534  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  62.17 
 
 		 263 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  55.6 
 
 		 266 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  55.6 
 
 		 266 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  55.3 
 
 		 266 aa  284  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  54.51 
 
 		 266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  54.51 
 
 		 266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  54.51 
 
 		 266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  54.51 
 
 		 266 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  55.68 
 
 		 266 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  55.25 
 
 		 257 aa  275  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  55.25 
 
 		 257 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  55.25 
 
 		 257 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  55.34 
 
 		 266 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  55.34 
 
 		 266 aa  271  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  54.09 
 
 		 257 aa  248  9e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  42.97 
 
 		 262 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 262 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 280 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  41.25 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 263 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 272 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 268 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  32.81 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  34.75 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  41.88 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  37.76 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  33.46 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3525  response regulator receiver protein  32.47 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243537  normal  0.113939 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  30.45 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 275 aa  125  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 299 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  34.36 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  33.2 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0389  LuxR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  28.57 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  34.47 
 
 		 263 aa  99  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  26.89 
 
 		 292 aa  97.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0032  putative transcriptional regulator  71.64 
 
 		 68 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.723962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0030  putative transcriptional regulator  71.64 
 
 		 68 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.514853 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  32.32 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  25.87 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  27.82 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2437  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.49 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1837  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 487 aa  58.9  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2655  transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.149331 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2089  two component LuxR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.954326  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  48.08 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2177  response regulator receiver protein  46.97 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.430622  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  47.17 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2786  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 511 aa  57  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0490323 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2723  transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 509 aa  56.2  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.397924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 680 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.11 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.45 
 
 		 925 aa  55.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13460  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  48.28 
 
 		 472 aa  55.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0436  transcriptional regulator, LuxR family  36.99 
 
 		 501 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1538  LuxR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 194 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 363 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0190  transcription regulator  41.67 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 461 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2837  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00000311945  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.86 
 
 		 215 aa  53.5  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0461  transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 542 aa  53.1  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  36.04 
 
 		 492 aa  53.1  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2795  transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 468 aa  53.1  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289432 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0072  transcriptional regulator, LuxR family  38.55 
 
 		 477 aa  53.1  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.323936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18530  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.56 
 
 		 209 aa  53.1  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1592  transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 518 aa  53.1  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355637 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2406  transcriptional regulator NarP  34.48 
 
 		 210 aa  52.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2779  transcriptional regulator, LuxR family  41.33 
 
 		 505 aa  52.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.980405 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2711  transcriptional regulator NarP  36.59 
 
 		 210 aa  52.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281479  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4059  two component LuxR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 212 aa  52.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11580  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.44 
 
 		 515 aa  52.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.937657  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>