More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1191 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3525  response regulator receiver protein  40.49 
 
 		 274 aa  193  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243537  normal  0.113939 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 267 aa  185  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  33.21 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 267 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  29.96 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  32.73 
 
 		 284 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 266 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 266 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 266 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  30.19 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 266 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 266 aa  132  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  32.69 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  33.46 
 
 		 268 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 266 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 266 aa  125  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  36.73 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  36.67 
 
 		 227 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  27.51 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 261 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  33.2 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  31.27 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  30.35 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 265 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  30.31 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  31.8 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0389  LuxR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 272 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 269 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 252 aa  90.1  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  25.54 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  25.81 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.91 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2491  LuxR response regulator receiver  50 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1496  LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2812  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000674561  hitchhiker  0.0000653029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0670  two component LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.998369  normal  0.706802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  44.29 
 
 		 879 aa  55.8  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1698  two component LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 191 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000145996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3796  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  58 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4239  regulatory protein, LuxR  42.37 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 209 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2299  transcriptional regulator NarL  50 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.590018  normal  0.644367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03368  predicted DNA-binding response regulator in two-component regulatory system  48.08 
 
 		 200 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000358261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0193  transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 200 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000210245  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 224 aa  53.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0197  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 200 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000437068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3925  transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 200 aa  53.5  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.237516  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4883  transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 200 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3824  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 200 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1854  LuxR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 310 aa  53.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2223  transcriptional regulator NarL  50 
 
 		 221 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134159  normal  0.207388 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3723  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 200 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03321  hypothetical protein  48.08 
 
 		 200 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00023179  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4008  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 200 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  32.53 
 
 		 221 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  46.55 
 
 		 217 aa  53.1  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 213 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1878  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 208 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3921  putative transcriptional regulator  48 
 
 		 200 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3878  putative transcriptional regulator  48 
 
 		 200 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>