263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4854 on replicon NC_009672
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  100 
 
 		 262 aa  551  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 257 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  50.4 
 
 		 257 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  41.1 
 
 		 247 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  38.82 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  34.24 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 282 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  30 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  35.19 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 266 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 266 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3525  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 274 aa  122  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243537  normal  0.113939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 298 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 299 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 262 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 301 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  34.69 
 
 		 279 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  29.12 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 265 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 272 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  28.03 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  26.15 
 
 		 292 aa  105  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  32.2 
 
 		 227 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  28.46 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  28.03 
 
 		 265 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 257 aa  98.6  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  24.71 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0389  LuxR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2837  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00000311945  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4328  transcriptional regulator, LuxR family  29.14 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127099  normal  0.0225245 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05580  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.62 
 
 		 512 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.735856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  35.04 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.35 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3999  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.11 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03730  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.9 
 
 		 426 aa  49.7  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.532687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5542  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.448293 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 210 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0602  transcriptional regulator, LuxR family protein  33.71 
 
 		 210 aa  49.3  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126322  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  33.05 
 
 		 210 aa  49.3  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1038  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 215 aa  48.9  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.942109  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11580  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.62 
 
 		 515 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.937657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  22.18 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2655  transcriptional regulator, LuxR family  38.36 
 
 		 470 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.149331 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0653  LuxR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.203226 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3294  LysR-family transcriptional regulator  25 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42203  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 212 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 212 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  32.48 
 
 		 212 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2723  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 509 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.397924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.48 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 212 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 214 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 212 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 212 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05930  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  39.66 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  31.62 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  31.62 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3299  LysR-family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212015  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>