127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4009 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 288 aa  576  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 269 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  34.53 
 
 		 272 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4633  response regulator receiver protein  30.04 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4782  transcriptional regulator, LuxR family  29.04 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10980  hypothetical protein  31.36 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  25.22 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2821  LuxR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.842744  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 266 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 266 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 266 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 257 aa  52.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  27.98 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1611  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 215 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  0.234442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 266 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 266 aa  49.7  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  43.4 
 
 		 206 aa  48.9  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4862  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  22.18 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0618  LuxR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5156  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.497351  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  25 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 207 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36 
 
 		 309 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 263 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 262 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 215 aa  46.2  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2670  LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 430 aa  45.8  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 270 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  25.74 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4015  response regulator receiver protein  33.98 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  33.93 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3322  transcriptional regulator, LuxR family  33.73 
 
 		 375 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.304808  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  23.5 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1286  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.13459  normal  0.233078 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24980  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.51 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4872  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4796  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.52 
 
 		 206 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00878953 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3314  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00833126  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.87 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3498  transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 73 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 845 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6161  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 221 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  decreased coverage  0.000109123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3769  transcriptional regulator, LuxR family  34.92 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0158689  normal  0.601222 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  30.36 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  30.36 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  38 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0846  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 209 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 370 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3365  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.01 
 
 		 216 aa  44.3  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7042  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 213 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4653  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 209 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1592  transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 518 aa  43.5  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355637 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4184  hypothetical protein  32 
 
 		 207 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.400045  normal  0.380291 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>