131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4190 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  70.79 
 
 		 269 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  69.29 
 
 		 269 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  65.54 
 
 		 272 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  63.43 
 
 		 272 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  61.62 
 
 		 272 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  68.81 
 
 		 204 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4633  response regulator receiver protein  33.73 
 
 		 273 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4782  transcriptional regulator, LuxR family  32.95 
 
 		 259 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10980  hypothetical protein  28.06 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  25.9 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  25.65 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4862  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  25.68 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2821  LuxR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.842744  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0774  regulatory protein, LuxR  27.45 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4239  regulatory protein, LuxR  25.6 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  24.89 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  21.72 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  21.72 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  20.43 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 267 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 266 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  21.59 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  25.2 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  24.55 
 
 		 250 aa  48.9  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 269 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0347  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  21.35 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  20.15 
 
 		 273 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  19.37 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  19.58 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1607  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  18.75 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2602  regulatory protein, LuxR  26.81 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.718  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 276 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1985  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  19.58 
 
 		 303 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1668  response regulator receiver  38.24 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0822  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 223 aa  46.6  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.628591  normal  0.692285 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  21.46 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 262 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  19.55 
 
 		 292 aa  45.8  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0745  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  35 
 
 		 895 aa  45.8  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  31.52 
 
 		 210 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 278 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  31.52 
 
 		 210 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 209 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 259 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 261 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2578  regulatory protein, LuxR  29.09 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  30.11 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2938  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.92 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2754  two component LuxR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221671  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  25.45 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1337  regulatory protein, LuxR  31.25 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2586  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.646343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2846  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.92 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.243379  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  25.51 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0143  transcription regulator  38.89 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3765  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  20.86 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0190  transcription regulator  38.89 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2086  two component transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 220 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>