63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0800 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  593  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  35.1 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4633  response regulator receiver protein  28.92 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1172  LuxR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4782  transcriptional regulator, LuxR family  30.34 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  34.51 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0774  regulatory protein, LuxR  45.45 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2821  LuxR family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.842744  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4239  regulatory protein, LuxR  26.64 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4862  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10980  hypothetical protein  27.78 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 263 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 259 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  24.29 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  40.3 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6468  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1258  response regulator VieA  36 
 
 		 584 aa  46.6  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.204001  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 262 aa  46.2  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  26.62 
 
 		 292 aa  46.2  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0389  LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 274 aa  45.8  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2210  LuxR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  27.61 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  24.26 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  25.36 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  39.68 
 
 		 205 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  26.29 
 
 		 284 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  25.88 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2833  transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 222 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2578  regulatory protein, LuxR  35.48 
 
 		 226 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3765  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 257 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 257 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 257 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3391  transcriptional regulator, LuxR family  39.62 
 
 		 171 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0382463  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 284 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  27.13 
 
 		 205 aa  42.7  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 280 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 280 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 270 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>