More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3391 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3391  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 171 aa  334  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0382463  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0377  transcriptional regulator, LuxR family  52.31 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3104  LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2088  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 217 aa  60.8  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5235  transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 134 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183919  normal  0.452557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0966  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0582  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1616  response regulator receiver  38.36 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.869432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  37.5 
 
 		 891 aa  58.9  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.93 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  41.94 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4163  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296115  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4449  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 253 aa  57.8  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2586  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.646343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0739  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.297506  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0618  transcriptional regulator, LuxR family  46.38 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0487  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.38 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0608  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.03 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10861  nitrate/nitrite response transcriptional regulatory protein narL  43.24 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000061441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6049  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.24 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  48.48 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.0443917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2794  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  48.33 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0730  two component LuxR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  48.33 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6962  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.24 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4575  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.77 
 
 		 224 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.703378  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0766  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  44.93 
 
 		 840 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4439  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.23 
 
 		 224 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0365  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 199 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.210231  normal  0.243335 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  44.07 
 
 		 217 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5117  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 253 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.180541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04700  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.86 
 
 		 198 aa  52.4  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.162406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0655  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 194 aa  52.4  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1813  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 249 aa  52.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.172477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 253 aa  52.4  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.58 
 
 		 213 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  35.06 
 
 		 218 aa  52.4  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 262 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2409  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 221 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.75 
 
 		 221 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1132  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 225 aa  52  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.893152  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2809  regulatory protein, LuxR  46.77 
 
 		 286 aa  52  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 228 aa  52  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2984  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  40 
 
 		 295 aa  52  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.43543  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2342  response regulator receiver  45.31 
 
 		 212 aa  52  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1162  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 225 aa  52  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1549  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 238 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196807  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.25 
 
 		 228 aa  51.6  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.62 
 
 		 233 aa  51.2  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3176  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 292 aa  51.2  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0570221  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5412  transcriptional regulator, LuxR family  38.03 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207706  normal  0.221863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3102  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 222 aa  51.6  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.774177  normal  0.15342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.97 
 
 		 212 aa  51.2  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4160  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 		 215 aa  51.2  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0201669  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1011  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.18 
 
 		 239 aa  51.2  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 200 aa  51.2  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5618  ATP-dependent transcription regulator LuxR  46.38 
 
 		 1383 aa  51.2  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.586723 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35 
 
 		 880 aa  51.2  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  43.55 
 
 		 221 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6539  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.7 
 
 		 198 aa  51.2  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 254 aa  51.2  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 229 aa  51.2  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 226 aa  50.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2754  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 215 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2938  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 215 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 210 aa  51.2  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4850  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 257 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.0399542 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.47 
 
 		 211 aa  50.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 228 aa  50.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2846  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 215 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.243379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1446  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 209 aa  50.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167897  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2104  two component LuxR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 233 aa  50.8  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 799 aa  50.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2158  LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 491 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 231 aa  50.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 231 aa  50.8  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3163  two component LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 203 aa  50.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.932633  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1379  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 292 aa  50.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0210202  hitchhiker  0.00446461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 205 aa  50.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3161  two component response regulator transcription regulator protein  43.48 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.71 
 
 		 913 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4877  PAS sensor protein  47.83 
 
 		 643 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 237 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1356  regulatory protein, LuxR  51.02 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 270 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3839  regulatory protein, LuxR  43.55 
 
 		 268 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  39.06 
 
 		 914 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5362  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 643 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>