More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5618 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5618  ATP-dependent transcription regulator LuxR  100 
 
 
1383 aa  2599    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.586723 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0923  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.89 
 
 
1235 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280541  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3636  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.04 
 
 
953 aa  115  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.36 
 
 
1003 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5034  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.4 
 
 
935 aa  108  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314145  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.47 
 
 
884 aa  104  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25 
 
 
867 aa  96.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  28.39 
 
 
947 aa  96.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  25 
 
 
900 aa  93.2  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.26 
 
 
1021 aa  92.8  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.21 
 
 
901 aa  92.4  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.15 
 
 
846 aa  87.8  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  26.05 
 
 
896 aa  86.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.85 
 
 
913 aa  82  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  21.05 
 
 
921 aa  80.9  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  47.92 
 
 
900 aa  80.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  24.01 
 
 
914 aa  78.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  23.92 
 
 
878 aa  77.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0766  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  34.48 
 
 
840 aa  74.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310851  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1523  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  63.93 
 
 
873 aa  73.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1524  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  72 
 
 
907 aa  71.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179507  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  24.21 
 
 
920 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.34 
 
 
877 aa  70.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  29.23 
 
 
1145 aa  68.6  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  30.99 
 
 
1204 aa  68.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  45.45 
 
 
766 aa  67  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.41 
 
 
910 aa  67.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
253 aa  66.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2469  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.01 
 
 
860 aa  65.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.81 
 
 
925 aa  65.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  24.13 
 
 
910 aa  65.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.6 
 
 
897 aa  64.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.28 
 
 
758 aa  64.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.96 
 
 
914 aa  63.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50.79 
 
 
1019 aa  63.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  50 
 
 
824 aa  63.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  23.82 
 
 
905 aa  63.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.65 
 
 
894 aa  62.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.86 
 
 
905 aa  62.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 
217 aa  62  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  19.49 
 
 
887 aa  61.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27.63 
 
 
749 aa  61.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0745  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  49.28 
 
 
895 aa  61.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  51.56 
 
 
933 aa  61.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2281  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  64.71 
 
 
730 aa  60.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.21 
 
 
914 aa  60.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  28.42 
 
 
1097 aa  60.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  26.72 
 
 
917 aa  60.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  28.68 
 
 
960 aa  60.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
947 aa  60.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  26.21 
 
 
1111 aa  60.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  24.57 
 
 
906 aa  60.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0475  regulatory protein LuxR  56.14 
 
 
271 aa  60.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0921  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  38.93 
 
 
881 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54574  normal  0.164383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3827  transcriptional regulator domain-containing protein  34.13 
 
 
1102 aa  59.3  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0262799 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  43.37 
 
 
896 aa  59.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  26.71 
 
 
1336 aa  58.9  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.51 
 
 
870 aa  58.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.33 
 
 
880 aa  58.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  43.37 
 
 
862 aa  58.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  29.41 
 
 
1110 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.71 
 
 
876 aa  57.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  24.29 
 
 
905 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.78 
 
 
262 aa  57.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  45.07 
 
 
209 aa  57.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  46.15 
 
 
914 aa  57  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29510  ATP-dependent transcriptional regulator  47.69 
 
 
992 aa  56.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.611914 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  32.74 
 
 
894 aa  57  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
905 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1706  transcriptional regulator  47.3 
 
 
827 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
259 aa  56.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1769  putative response regulator  37.66 
 
 
231 aa  55.8  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0607  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.23 
 
 
216 aa  56.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0621  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  50.75 
 
 
824 aa  55.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000506024  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.57 
 
 
911 aa  55.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  21.28 
 
 
902 aa  55.5  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.07 
 
 
922 aa  55.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  23.47 
 
 
903 aa  55.5  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  20.89 
 
 
902 aa  55.5  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19850  putative transcriptional regulator  47.3 
 
 
827 aa  55.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.326832  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  23.47 
 
 
903 aa  55.5  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  26.39 
 
 
904 aa  55.5  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4163  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 
208 aa  55.1  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296115  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0182  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 
85 aa  55.5  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2039  LuxR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
917 aa  54.3  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0907  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.33 
 
 
850 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
231 aa  54.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.67 
 
 
215 aa  54.7  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  28.99 
 
 
1095 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0655  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
194 aa  54.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  46.88 
 
 
891 aa  54.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1063  LuxR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
917 aa  54.3  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1348  LuxR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
917 aa  54.3  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.554665  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2330  LuxR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
917 aa  54.3  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1436  GerE family regulatory protein  37.86 
 
 
921 aa  54.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1616  response regulator receiver  36.25 
 
 
210 aa  54.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.869432  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  41.77 
 
 
901 aa  54.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  41.77 
 
 
924 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  28.82 
 
 
899 aa  54.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0474  ATP-dependent transcriptional regulator protein- like protein  28.76 
 
 
578 aa  53.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>