More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0475 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0475  regulatory protein LuxR  100 
 
 		 271 aa  540  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0766  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  39.16 
 
 		 840 aa  80.5  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5034  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  34.58 
 
 		 935 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1524  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.42 
 
 		 907 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1523  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  54.55 
 
 		 873 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  41.67 
 
 		 884 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  38.4 
 
 		 846 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2281  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  53.33 
 
 		 730 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.84 
 
 		 880 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.78 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0923  ATP-dependent transcription regulator LuxR  57.38 
 
 		 1235 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1249  response regulator  42.65 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0947405  normal  0.0892263 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4084  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0745  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  51.56 
 
 		 895 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  31.11 
 
 		 824 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5618  ATP-dependent transcription regulator LuxR  54.84 
 
 		 1383 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.586723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  31.03 
 
 		 901 aa  59.7  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  29.01 
 
 		 904 aa  59.3  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  45.9 
 
 		 921 aa  59.3  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4439  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.54 
 
 		 876 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  38.2 
 
 		 901 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  38.2 
 
 		 901 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  38.2 
 
 		 901 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0724  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.59 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.836709 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  38.2 
 
 		 901 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  38.2 
 
 		 901 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  38.2 
 
 		 902 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  38.2 
 
 		 901 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  38.2 
 
 		 901 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  38.2 
 
 		 901 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  38.2 
 
 		 901 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  52.46 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  35.05 
 
 		 903 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  35.05 
 
 		 903 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0047  transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 80 aa  57  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.284313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  39.06 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  44.78 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 454 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6044  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0182  transcriptional regulator, LuxR family  55 
 
 		 85 aa  55.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  37.08 
 
 		 901 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  37.08 
 
 		 901 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3664  regulatory protein, LuxR  38.46 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  35.11 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3102  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.78 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.774177  normal  0.15342 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.72 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  37.08 
 
 		 901 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3161  two component response regulator transcription regulator protein  42.62 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  47.54 
 
 		 947 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.71 
 
 		 867 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3515  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150532  hitchhiker  0.00248481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1932  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0592371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.0443917 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  47.54 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 904 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2254  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  37.21 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0756  LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2108  transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 516 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00926757  normal  0.183235 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0615  transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 		 462 aa  53.9  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000110739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3409  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.32 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306896  hitchhiker  0.000114505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3835  two component LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 217 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  33.57 
 
 		 933 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  26.37 
 
 		 921 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1977  regulatory protein LuxR  45 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03493  hypothetical protein  42.37 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2762  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  44.07 
 
 		 520 aa  53.5  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1616  response regulator receiver  29.1 
 
 		 210 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.869432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 781 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 209 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0181  transcriptional regulator, LuxR family  41.43 
 
 		 600 aa  53.1  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 243 aa  53.1  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.26 
 
 		 894 aa  52.8  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5557  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  47.54 
 
 		 218 aa  53.1  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5021  putative transcriptional regulator  42.19 
 
 		 855 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00982675  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0504  transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 217 aa  53.1  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0705101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40.98 
 
 		 1019 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5044  LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 230 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 228 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 236 aa  53.1  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 231 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5351  transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 229 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649636  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1162  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 225 aa  52.8  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0757  LuxR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 210 aa  52.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.88 
 
 		 217 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05580  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  29.29 
 
 		 512 aa  52.4  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.735856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3355  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.75 
 
 		 208 aa  52.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.687232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>