More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3664 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3664  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 215 aa  425  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1356  regulatory protein, LuxR  43.63 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2440  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 		 220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000119534  normal  0.0380024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1337  regulatory protein, LuxR  45.26 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.92 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  26.83 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 233 aa  72  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1619  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 163 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113726  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 163 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1592  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 162 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.85 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0739  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.52 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.297506  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  47.14 
 
 		 496 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.54 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.54 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2345  two component transcriptional regulator  28.37 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499423  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.7 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  27.27 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.63 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1410  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.03 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.46664  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0180  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.51 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.245465  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2145  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.04 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  31.1 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.14 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.41 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3179  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.13 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.05 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.28 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  28.22 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2079  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.19 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.63 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.64 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.51 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.22 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1651  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.22 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  27.27 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  31.92 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.84 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  30.13 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  33.58 
 
 		 556 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1496  LuxR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.43 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2905  transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5845  LuxR response regulator receiver  29.72 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6717  transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 509 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.25 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.09 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1057  transcriptional regulator, LuxR family  41.75 
 
 		 486 aa  62  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.113368 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  28.17 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  28.17 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  28.17 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5649  LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 486 aa  62  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.090782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  28.17 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.96 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4460  LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 486 aa  62  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.478893 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  28.17 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3519  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5287  transcriptional regulator, LuxR family  34.44 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  30.3 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0096  transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 78 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  27.83 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6161  response regulator receiver protein  28.77 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  decreased coverage  0.000109123 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0349  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.83845 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429674  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.09 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0363  PAS sensor protein  39.81 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  34.85 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3299  LuxR response regulator receiver  27.62 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0158345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1848  transcriptional regulator NarL  24.66 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0393  transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2158  LuxR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  26.98 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0637  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  35.61 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  30.07 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  27.7 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0365  two component LuxR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.210231  normal  0.243335 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2443  LuxR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 497 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3523  two component LuxR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  27.31 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.77 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1418  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>