More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0182 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0182  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 85 aa  167  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0047  transcriptional regulator, LuxR family  82.54 
 
 		 80 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.284313  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0096  transcriptional regulator, LuxR family  69.33 
 
 		 78 aa  103  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3120  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  40 
 
 		 854 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2440  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.33 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000119534  normal  0.0380024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  35.29 
 
 		 496 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2443  LuxR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 497 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0766  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  45.9 
 
 		 840 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3664  regulatory protein, LuxR  41.79 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  48.44 
 
 		 884 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2332  response regulator receiver protein  40 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2158  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 491 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0475  regulatory protein LuxR  55 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  43.66 
 
 		 846 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5618  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45 
 
 		 1383 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.586723 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1517  transcriptional regulator, LuxR family protein  41.1 
 
 		 210 aa  53.9  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.776537  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1726  LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 208 aa  53.9  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.474249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2114  transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 191 aa  53.5  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000451621  normal  0.459179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2725  LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 211 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2316  LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 211 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2386  LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 211 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2509  LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 211 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592216  hitchhiker  0.00000482381 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0923  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.21 
 
 		 1235 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1832  LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 211 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2490  transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 211 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03493  hypothetical protein  38.46 
 
 		 213 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1337  regulatory protein, LuxR  39.39 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1356  regulatory protein, LuxR  35 
 
 		 217 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 202 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1796  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 211 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1817  LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 211 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.596206  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1446  response regulator receiver protein  40.3 
 
 		 209 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167897  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0745  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  46.67 
 
 		 895 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1788  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 211 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3414  LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 514 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2327  regulatory protein, LuxR  42.19 
 
 		 210 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  37.14 
 
 		 221 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2759  response regulator receiver protein  40.85 
 
 		 211 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550861  normal  0.145492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 514 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1446  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 210 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0398792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3813  PAS sensor protein  43.55 
 
 		 500 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5154  LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 510 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36550  ATP-dependent transcriptional regulator  46.55 
 
 		 846 aa  51.2  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2680  LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 514 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3471  LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 510 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.03 
 
 		 228 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4050  LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 510 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06533  hypothetical protein  43.94 
 
 		 217 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001276  transcriptional regulator VpsT  42.11 
 
 		 210 aa  50.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1880  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 210 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03170  ATP-dependent transcriptional regulator  45 
 
 		 868 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  44.44 
 
 		 221 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1523  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  45 
 
 		 873 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2905  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 335 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0210  transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 500 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  39.29 
 
 		 222 aa  50.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2231  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  41.82 
 
 		 216 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.750523  normal  0.99411 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1238  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  41.82 
 
 		 216 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  46.55 
 
 		 905 aa  50.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1253  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  41.82 
 
 		 216 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.705931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1208  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  41.82 
 
 		 216 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316434  normal  0.419874 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5649  LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 486 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.090782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2048  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  41.82 
 
 		 216 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0804096  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4460  LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 486 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.478893 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01037  DNA-binding transcriptional activator in two-component regulatory system  41.82 
 
 		 216 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29510  ATP-dependent transcriptional regulator  39.06 
 
 		 992 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.611914 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2605  transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 216 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.196673  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  39.29 
 
 		 222 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2559  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  41.82 
 
 		 216 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.980478  normal  0.382247 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17000  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.15 
 
 		 233 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1633  regulatory protein, LuxR  40 
 
 		 732 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162775 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1158  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  41.82 
 
 		 216 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.354651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1159  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  41.82 
 
 		 216 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  41.27 
 
 		 758 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1419  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  41.82 
 
 		 216 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132272 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01044  hypothetical protein  41.82 
 
 		 216 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2145  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 220 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196231  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2093  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  41.82 
 
 		 190 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 232 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  43.33 
 
 		 766 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1820  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 216 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  normal  0.0923177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2281  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  46.15 
 
 		 730 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2536  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  46.43 
 
 		 216 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 222 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1903  transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000231921 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0029  two component LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 220 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268532  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05153  hypothetical protein  40.35 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  40 
 
 		 749 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3306  LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 238 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  38.16 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 781 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 228 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0363  PAS sensor protein  40.3 
 
 		 278 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  44.64 
 
 		 896 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 215 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  38.71 
 
 		 914 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2357  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 234 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.9 
 
 		 204 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1556  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  41.82 
 
 		 216 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417219  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6717  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 509 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>