More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2490 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1788  response regulator receiver protein  100 
 
 		 211 aa  433  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1796  response regulator receiver protein  100 
 
 		 211 aa  433  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1832  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  433  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2490  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 211 aa  433  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2509  LuxR family transcriptional regulator  95.26 
 
 		 211 aa  417  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592216  hitchhiker  0.00000482381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2316  LuxR family transcriptional regulator  94.79 
 
 		 211 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2386  LuxR family transcriptional regulator  94.79 
 
 		 211 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2725  LuxR family transcriptional regulator  93.84 
 
 		 211 aa  410  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2332  response regulator receiver protein  89.57 
 
 		 211 aa  394  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1446  response regulator receiver protein  64.62 
 
 		 210 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0398792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2327  regulatory protein, LuxR  62.38 
 
 		 210 aa  275  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1517  transcriptional regulator, LuxR family protein  62.15 
 
 		 210 aa  269  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.776537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2759  response regulator receiver protein  61.24 
 
 		 211 aa  266  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550861  normal  0.145492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1880  LuxR family transcriptional regulator  61.24 
 
 		 210 aa  263  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1726  LuxR family transcriptional regulator  61.24 
 
 		 208 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.474249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1817  LuxR family transcriptional regulator  55.98 
 
 		 211 aa  245  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.596206  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1556  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  33.95 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417219  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2858  probable CsgAB operon transcriptional regulatory protein  29.08 
 
 		 215 aa  94.7  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.256874  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1159  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  32.72 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1419  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  32.72 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132272 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1158  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  32.72 
 
 		 216 aa  94  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.354651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2559  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  32.72 
 
 		 216 aa  94  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.980478  normal  0.382247 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2093  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  32.72 
 
 		 190 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.661259 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01037  DNA-binding transcriptional activator in two-component regulatory system  32.72 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2605  transcriptional regulator, LuxR family  32.72 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.196673  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01044  hypothetical protein  32.72 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1253  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  33.33 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.705931 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1238  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  33.33 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1208  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  33.33 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316434  normal  0.419874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2048  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  33.33 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0804096  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2231  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  33.33 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.750523  normal  0.99411 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0287  LuxR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1053  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002362  DNA-binding HTH domain-containing protein  36.57 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0501055  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03706  hypothetical protein  35.34 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  27.37 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06533  hypothetical protein  40.16 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3306  LuxR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.74 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  31.71 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2814  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05153  hypothetical protein  34.07 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  35.65 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001276  transcriptional regulator VpsT  32.03 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1011  two component transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  32.1 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  35.85 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4115  response regulator receiver protein  33.54 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071707  normal  0.0608108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.36 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0365  two component LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.210231  normal  0.243335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.61 
 
 		 1648 aa  65.5  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.6 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  53.33 
 
 		 896 aa  65.5  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  29.63 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2586  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.4 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.646343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.79 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4688  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.51 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.93 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  28.48 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.35 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1210  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.92 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10861  nitrate/nitrite response transcriptional regulatory protein narL  35.51 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000061441 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  51.67 
 
 		 933 aa  62.4  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.16 
 
 		 234 aa  62  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2278  LuxR response regulator receiver  54.55 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0739  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.71 
 
 		 204 aa  62  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.297506  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1817  LuxR response regulator receiver  51.56 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3277  transcriptional regulator, LuxR family  30.29 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1000  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4745  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.48 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2905  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3333  response regulator receiver protein  23.64 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2658  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.04 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0254  LuxR family DNA-binding response regulator  27.27 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03493  hypothetical protein  31.93 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 914 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8800  response regulator receiver protein  47.37 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 544 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  29.19 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 544 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  51.72 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0644  LuxR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140532  unclonable  0.00000001613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>