More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3333 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3333  response regulator receiver protein  100 
 
 		 196 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001276  transcriptional regulator VpsT  34.92 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05153  hypothetical protein  38.24 
 
 		 218 aa  94  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03706  hypothetical protein  35.82 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002362  DNA-binding HTH domain-containing protein  35.07 
 
 		 214 aa  88.2  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0501055  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2858  probable CsgAB operon transcriptional regulatory protein  32.56 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.256874  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0287  LuxR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1053  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06533  hypothetical protein  36.5 
 
 		 217 aa  85.9  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2814  LuxR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  31.91 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  29.78 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1556  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  31.21 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417219  normal  0.369793 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2605  transcriptional regulator, LuxR family  29.08 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.196673  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2559  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  29.08 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.980478  normal  0.382247 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1158  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  29.08 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.354651  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2093  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  29.08 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1419  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  29.08 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132272 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1159  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  29.08 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01037  DNA-binding transcriptional activator in two-component regulatory system  29.08 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01044  hypothetical protein  29.08 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1208  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  29.08 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316434  normal  0.419874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1238  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  29.08 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2048  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  29.08 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0804096  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2231  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  29.08 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.750523  normal  0.99411 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1253  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  29.08 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.705931 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3306  LuxR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  29.7 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  23.6 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03493  hypothetical protein  29.14 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1817  LuxR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.596206  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2905  transcriptional regulator, LuxR family  27.81 
 
 		 335 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1726  LuxR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.474249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1880  LuxR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0633  LuxR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2759  response regulator receiver protein  22.16 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550861  normal  0.145492 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2490  transcriptional regulator, LuxR family  23.64 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1832  LuxR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1446  response regulator receiver protein  23.49 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0398792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1796  response regulator receiver protein  23.64 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1788  response regulator receiver protein  23.64 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2725  LuxR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4028  two component LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3302  LuxR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1517  transcriptional regulator, LuxR family protein  28.36 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.776537  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3194  LuxR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0232917  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2620  response regulator receiver protein  27.03 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.649971  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2327  regulatory protein, LuxR  26.87 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4648  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3704  LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0339608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2948  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  36.17 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.9 
 
 		 932 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2316  LuxR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2386  LuxR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2509  LuxR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592216  hitchhiker  0.00000482381 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01507  putative transcriptional regulator, LuxR family protein  26.06 
 
 		 159 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.993499  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  27.27 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2317  LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000209491  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2332  response regulator receiver protein  22.42 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  33.94 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3005  two component LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00815247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40 
 
 		 889 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2648  LuxR family DNA-binding response regulator  25.58 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03258  two-component system regulatory protein  30.63 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.48 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.31 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03610  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  49.09 
 
 		 470 aa  54.7  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.166414  normal  0.0491532 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2305  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  27.78 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2674  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00219271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.02 
 
 		 924 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.02 
 
 		 930 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2370  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  33.33 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  36.56 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0560  transcriptional regulator, LuxR family protein  25.42 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4147  two component LuxR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3887  LuxR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000207134 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1138  two component LuxR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 226 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.914207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  44.44 
 
 		 913 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2145  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.93 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196231  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0209  two component LuxR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  36.07 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  24.64 
 
 		 597 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  26.6 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 904 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.15 
 
 		 234 aa  52.4  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23170  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.44 
 
 		 474 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.23412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4386  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.7 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>