More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1556 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_1556  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  100 
 
 		 216 aa  447  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417219  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2231  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  88.43 
 
 		 216 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.750523  normal  0.99411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2048  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  88.43 
 
 		 216 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0804096  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1208  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  88.43 
 
 		 216 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316434  normal  0.419874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1419  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  87.5 
 
 		 216 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132272 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1253  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  87.96 
 
 		 216 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.705931 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1159  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  87.5 
 
 		 216 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1238  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  87.96 
 
 		 216 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147361  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01037  DNA-binding transcriptional activator in two-component regulatory system  87.04 
 
 		 216 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2605  transcriptional regulator, LuxR family  87.04 
 
 		 216 aa  394  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.196673  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1158  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  87.5 
 
 		 216 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.354651  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01044  hypothetical protein  87.04 
 
 		 216 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2559  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  87.5 
 
 		 216 aa  396  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.980478  normal  0.382247 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2093  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  86.32 
 
 		 190 aa  348  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  35.58 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  35.24 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001276  transcriptional regulator VpsT  33.64 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05153  hypothetical protein  42.96 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0287  LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 224 aa  114  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1053  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3306  LuxR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2858  probable CsgAB operon transcriptional regulatory protein  40.52 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.256874  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06533  hypothetical protein  39.71 
 
 		 217 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2759  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550861  normal  0.145492 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2725  LuxR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2490  transcriptional regulator, LuxR family  33.95 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1832  LuxR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1796  response regulator receiver protein  33.95 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1788  response regulator receiver protein  33.95 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1517  transcriptional regulator, LuxR family protein  36.02 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.776537  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002362  DNA-binding HTH domain-containing protein  35.29 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0501055  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2332  response regulator receiver protein  32.72 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2814  LuxR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2316  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2386  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2509  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592216  hitchhiker  0.00000482381 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1446  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 210 aa  95.5  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0398792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1817  LuxR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 211 aa  95.1  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.596206  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  30.92 
 
 		 221 aa  95.1  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2327  regulatory protein, LuxR  32.3 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03706  hypothetical protein  33.82 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1726  LuxR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.474249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1880  LuxR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3333  response regulator receiver protein  31.21 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.15 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2905  transcriptional regulator, LuxR family  39.64 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3704  LuxR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0339608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.18 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.53 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  41.58 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.88 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01507  putative transcriptional regulator, LuxR family protein  34.23 
 
 		 159 aa  70.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.993499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.14 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.54 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.18 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  40.22 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03493  hypothetical protein  33.87 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  30 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.59 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  30 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  25.6 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4115  response regulator receiver protein  28.03 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071707  normal  0.0608108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.89 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.38 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.78 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  28.44 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  36.63 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.59 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  34.65 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.25 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2881  response regulator receiver  38.95 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00126066  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.61 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  28.22 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.19 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.7 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0644  LuxR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140532  unclonable  0.00000001613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>