More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1000 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1000  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 177 aa  359  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4026  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.11 
 
 		 200 aa  206  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.105506  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00157  transcriptional regulator LuxR  37.58 
 
 		 211 aa  98.6  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0866  two component LuxR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 220 aa  97.1  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  32.69 
 
 		 213 aa  96.7  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 221 aa  96.7  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2275  LuxR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2354  two component LuxR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 236 aa  95.9  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002211  transcriptional regulator LuxR family  37.58 
 
 		 209 aa  95.1  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  30.59 
 
 		 223 aa  93.6  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2689  two component LuxR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 224 aa  93.2  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0164  two component LuxR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 215 aa  92  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 231 aa  92  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3954  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 229 aa  92  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2824  transcriptional regulator, LuxR response regulator receiver  35.47 
 
 		 209 aa  91.7  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  29.19 
 
 		 214 aa  90.9  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 216 aa  90.9  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003098  BarA-associated response regulator UvrY  29.19 
 
 		 188 aa  90.9  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000268807  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0264  two component LuxR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 221 aa  89.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0991  two component LuxR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 210 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 209 aa  89.4  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  29.19 
 
 		 227 aa  89.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 222 aa  89  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.68 
 
 		 223 aa  89  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  28.57 
 
 		 214 aa  89  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 213 aa  89  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  29.19 
 
 		 226 aa  89.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2305  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  31.43 
 
 		 220 aa  88.6  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0584  two component response regulator  30 
 
 		 215 aa  87.8  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  30.11 
 
 		 224 aa  87.8  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  30.11 
 
 		 224 aa  87.8  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.33 
 
 		 209 aa  87.8  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2357  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.57 
 
 		 234 aa  87.8  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.93 
 
 		 224 aa  87.4  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.08 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 230 aa  87  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2326  two component LuxR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 210 aa  87  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000518478 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1571  XRE family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 207 aa  86.3  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 221 aa  86.3  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0960  two component LuxR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 214 aa  85.9  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  30.36 
 
 		 207 aa  86.3  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  32.7 
 
 		 207 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 218 aa  85.9  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.63 
 
 		 210 aa  85.5  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 215 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4871  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.54 
 
 		 222 aa  85.1  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134443  normal  0.31614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38490  Response regulator, LuxR family  32.4 
 
 		 215 aa  85.1  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.54 
 
 		 211 aa  84.7  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 220 aa  85.1  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 215 aa  84.7  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  29.63 
 
 		 214 aa  85.1  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1197  two component LuxR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 225 aa  84.7  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0485473 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  30.54 
 
 		 215 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 222 aa  84.7  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.49 
 
 		 210 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1182  two component LuxR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 216 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4024  two component LuxR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 216 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136895 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.49 
 
 		 210 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  27.33 
 
 		 218 aa  84.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 226 aa  84.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3254  two component LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 201 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  30.54 
 
 		 215 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  29.57 
 
 		 224 aa  84  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.29 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2570  two component LuxR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.51 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.8 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.79 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1574  two component LuxR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  33.53 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.69 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  29.94 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4027  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.47 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  29.94 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  29.94 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  29.94 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  29.94 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  29.81 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  32.47 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1594  response regulator  26.09 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.721789  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  29.94 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  29.94 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3170  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  29.51 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.92 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1635  LuxR family two component transcriptional regulator  33.12 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.4 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4082  two component LuxR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0219  two component transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.463895 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3305  LuxR family DNA-binding response regulator  34 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1237  two component LuxR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>