More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03170 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03170  ATP-dependent transcriptional regulator  100 
 
 		 868 aa  1649    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4102  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  29.46 
 
 		 859 aa  232  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3120  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  30.1 
 
 		 854 aa  144  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36550  ATP-dependent transcriptional regulator  29.22 
 
 		 846 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  24.83 
 
 		 902 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  24.43 
 
 		 902 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  23.49 
 
 		 916 aa  79.7  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  25.83 
 
 		 921 aa  70.1  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0047  transcriptional regulator, LuxR family  45.71 
 
 		 80 aa  64.3  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.284313  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3844  regulatory protein, LuxR  28.81 
 
 		 944 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1523  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.27 
 
 		 873 aa  63.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  23.57 
 
 		 901 aa  63.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  23.26 
 
 		 904 aa  61.2  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.28 
 
 		 914 aa  60.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  47.06 
 
 		 884 aa  60.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.24 
 
 		 1019 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 799 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.93 
 
 		 930 aa  59.7  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1651  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 218 aa  59.7  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1583  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.87 
 
 		 955 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.559531  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29510  ATP-dependent transcriptional regulator  32.49 
 
 		 992 aa  59.3  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.611914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  26.8 
 
 		 914 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1602  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.87 
 
 		 897 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208535 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  21.84 
 
 		 903 aa  58.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3567  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 914 aa  58.5  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  21.84 
 
 		 903 aa  58.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  26.13 
 
 		 904 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1633  regulatory protein, LuxR  44.05 
 
 		 732 aa  58.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162775 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  41.12 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  28.89 
 
 		 901 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4809  regulatory protein, LuxR  26.53 
 
 		 717 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17127 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 243 aa  55.8  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  43.14 
 
 		 285 aa  56.2  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2039  LuxR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 917 aa  55.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.96 
 
 		 901 aa  55.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 213 aa  55.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2330  LuxR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 917 aa  55.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0096  transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 78 aa  55.5  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1063  LuxR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 917 aa  55.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1348  LuxR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 917 aa  55.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.554665  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  27.31 
 
 		 924 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4082  regulatory protein, LuxR  26.75 
 
 		 888 aa  55.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.566011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4163  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.37 
 
 		 208 aa  54.3  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296115  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 209 aa  54.7  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1136  regulatory protein, LuxR  36.08 
 
 		 868 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.87643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2814  LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 146 aa  54.3  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4871  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 222 aa  54.3  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134443  normal  0.31614 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0502  regulatory protein, LuxR  42.31 
 
 		 861 aa  54.3  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0169233  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3120  response regulator receiver  45.83 
 
 		 212 aa  54.3  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.230577  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.75 
 
 		 924 aa  53.9  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 904 aa  53.9  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  42.47 
 
 		 917 aa  54.3  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3217  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.38 
 
 		 891 aa  53.9  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000769208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 246 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 253 aa  53.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 781 aa  53.5  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.42 
 
 		 766 aa  53.5  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  41.94 
 
 		 921 aa  53.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.44 
 
 		 880 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  42.65 
 
 		 947 aa  52.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 254 aa  52.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.97 
 
 		 900 aa  52.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  20.54 
 
 		 901 aa  52.4  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0487  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.35 
 
 		 215 aa  52.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 221 aa  52.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.86 
 
 		 905 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 214 aa  52.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10861  nitrate/nitrite response transcriptional regulatory protein narL  43.02 
 
 		 216 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000061441 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.06 
 
 		 213 aa  52  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 967 aa  52  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06533  hypothetical protein  49.12 
 
 		 217 aa  52  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.09 
 
 		 925 aa  52  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 216 aa  52  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6705  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.14 
 
 		 258 aa  51.6  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318103  normal  0.0731204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  37.62 
 
 		 824 aa  51.2  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001276  transcriptional regulator VpsT  45.61 
 
 		 210 aa  51.6  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  45.61 
 
 		 896 aa  51.6  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.1 
 
 		 922 aa  51.2  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 188 aa  51.2  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 292 aa  51.2  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1242  transcriptional regulator, LuxR family  44.93 
 
 		 81 aa  51.2  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0473699  normal  0.519491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  43.59 
 
 		 562 aa  50.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.99 
 
 		 911 aa  51.2  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1162  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  51.2  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 544 aa  51.2  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0292  hypothetical protein  22.54 
 
 		 954 aa  51.2  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0090168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 544 aa  51.2  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  48.39 
 
 		 913 aa  51.2  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1788  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 211 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  20 
 
 		 901 aa  50.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  20 
 
 		 901 aa  50.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  42.42 
 
 		 914 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 254 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1796  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 211 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>