More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1242 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1242  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 81 aa  160  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0473699  normal  0.519491 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.78 
 
 		 235 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 216 aa  67  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 216 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 544 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 544 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 544 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3704  LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0339608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 213 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 219 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3991  putative GAF sensor protein  44.29 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3999  transcriptional regulator, LuxR family  37.8 
 
 		 260 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1611  two component LuxR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 215 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  0.234442 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  46.48 
 
 		 206 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  44.26 
 
 		 217 aa  60.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1686  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 240 aa  60.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173725  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  44.83 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 554 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2885  LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 545 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.488052  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3589  two component LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  0.0443312 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3716  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 443 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00102853  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  47.54 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  47.54 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  47.54 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  47.54 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1006  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4328  transcriptional regulator, LuxR family  36.59 
 
 		 260 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127099  normal  0.0225245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  46.38 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  48.44 
 
 		 562 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.56 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  43.1 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4028  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  42.86 
 
 		 222 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1867  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 219 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00198288  hitchhiker  0.000309651 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 218 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2370  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  44.26 
 
 		 203 aa  57.4  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 218 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0692  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 206 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 218 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2721  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 219 aa  57  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 541 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1981  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.607794  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  45.31 
 
 		 218 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4184  hypothetical protein  51.92 
 
 		 207 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.400045  normal  0.380291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2525  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 215 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 213 aa  57  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3475  response regulator receiver  45.76 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4059  two component LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1030  regulatory protein, LuxR  55.77 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 228 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4781  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0502492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  49.15 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001276  transcriptional regulator VpsT  44.44 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2245  two component LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00227369  normal  0.0543921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1794  transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 537 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000182459 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3878  putative transcriptional regulator  45.16 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3981  putative transcriptional regulator  45.16 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.347336 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3716  two component LuxR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.576881  normal  0.099275 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1627  two component LuxR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0484719  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2626  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.390788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0691  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3306  LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2554  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.958854  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 526 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3800  putative transcriptional regulator  45.16 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  49.12 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  44.78 
 
 		 526 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3921  putative transcriptional regulator  45.16 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  44.78 
 
 		 526 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3813  putative transcriptional regulator  45.16 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>