More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0691 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0691  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  457  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0211  two component LuxR family transcriptional regulator  84.58 
 
 		 227 aa  396  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.196171  normal  0.645513 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.26 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  33.49 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  33.65 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6596  two component LuxR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 249 aa  98.2  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.11 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.37 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 216 aa  95.5  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  30.7 
 
 		 213 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 250 aa  94.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1981  two component LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.607794  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.39 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 236 aa  93.6  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  32.38 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.38 
 
 		 235 aa  92.8  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  33.17 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  31.98 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2073  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000764485 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  31.92 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  31.92 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.08 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 224 aa  92.4  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6192  two component LuxR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 231 aa  92  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  0.0472092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  32.51 
 
 		 213 aa  92  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 244 aa  91.7  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  33.02 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  33.02 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  33.02 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  33.66 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  33.02 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.6 
 
 		 225 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.48 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.02 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  33.33 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  33.5 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  29.77 
 
 		 213 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  30.84 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  34.31 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.57 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  35.55 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  35.02 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38490  Response regulator, LuxR family  31.37 
 
 		 215 aa  90.1  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0094  two component LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 213 aa  90.1  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3676  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.33 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0625047  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000126323  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1731  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.55 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5633  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.67 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.603295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  32.52 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 242 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.28 
 
 		 218 aa  89  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  35.68 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.55 
 
 		 226 aa  89.4  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  33 
 
 		 210 aa  89  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 228 aa  88.6  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 231 aa  88.6  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2024  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.55 
 
 		 220 aa  88.6  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 242 aa  88.6  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1373  DNA-binding response regulator, LuxR family  30.32 
 
 		 238 aa  88.2  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.19 
 
 		 234 aa  88.2  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.66 
 
 		 230 aa  88.2  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  32.71 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2225  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 303 aa  87.8  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4344  two component LuxR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218307 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  32.11 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.41 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  31.65 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.53 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3475  response regulator receiver  31.6 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.65 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  35.24 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>