More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1627 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1627  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  497  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0484719  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3000  two component LuxR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 263 aa  122  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.42213  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  38.18 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1006  two component LuxR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  32.23 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  34.32 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1399  transcriptional regulator NarL  35.8 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4863  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.51 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.937693  normal  0.105083 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.72 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4715  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.525745 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4346  regulatory protein LuxR  33.04 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  95.9  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7667  two component LuxR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  35.71 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3578  regulatory protein LuxR  31.72 
 
 		 253 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0721369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.62 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 220 aa  92  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  30.04 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 219 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  32.74 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  32.74 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1848  transcriptional regulator NarL  37.5 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0960  two component LuxR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 214 aa  90.9  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.3 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.82 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  32.35 
 
 		 213 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.11 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.97 
 
 		 206 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  34.52 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 217 aa  89  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.31 
 
 		 215 aa  89  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 216 aa  89  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 219 aa  88.6  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  28.23 
 
 		 207 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  29.95 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 218 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4366  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.84 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.46 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2223  transcriptional regulator NarL  37.68 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134159  normal  0.207388 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 214 aa  87  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3716  two component LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 209 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.576881  normal  0.099275 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 223 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  36.49 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.88 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  36.49 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  36.49 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  36.49 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  36.49 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1571  XRE family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1766  transcriptional regulator NarL  34.13 
 
 		 216 aa  86.3  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.63 
 
 		 223 aa  85.9  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.67 
 
 		 253 aa  85.9  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4598  two component LuxR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 236 aa  85.9  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 214 aa  85.9  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.24 
 
 		 212 aa  86.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2836  two component LuxR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 207 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2299  transcriptional regulator NarL  36.96 
 
 		 221 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.590018  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  29.49 
 
 		 216 aa  85.9  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 221 aa  85.5  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 213 aa  85.1  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 218 aa  85.5  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 218 aa  85.5  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  35.86 
 
 		 219 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.86 
 
 		 224 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.43 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1125  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.46 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  33.13 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  32.74 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.24 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.73 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2794  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  30 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  35.81 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0239  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.56 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0646  response regulator receiver protein  33.12 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0492071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.28 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.02 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  35.57 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  35.81 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>