More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1848 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1848  transcriptional regulator NarL  100 
 
 		 215 aa  433  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1766  transcriptional regulator NarL  84.91 
 
 		 216 aa  343  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2262  transcriptional regulator NarL  84.65 
 
 		 216 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0331529  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2568  transcriptional regulator NarL  84.19 
 
 		 216 aa  322  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2900  transcriptional regulator NarL  81.82 
 
 		 216 aa  321  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1388  transcriptional regulator NarL  81.31 
 
 		 216 aa  313  9e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01199  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarX (or NarQ)  81.31 
 
 		 216 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2425  two component transcriptional regulator, LuxR family  81.31 
 
 		 216 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00984481  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1704  transcriptional regulator NarL  81.31 
 
 		 216 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01209  hypothetical protein  81.31 
 
 		 216 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2402  transcriptional regulator NarL  81.31 
 
 		 216 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000198441 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1330  transcriptional regulator NarL  81.31 
 
 		 216 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.724195  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1371  transcriptional regulator NarL  81.31 
 
 		 216 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.213666  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1919  transcriptional regulator NarL  81.31 
 
 		 216 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.11445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1373  transcriptional regulator NarL  80.56 
 
 		 216 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.276843  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1962  transcriptional regulator NarL  80.56 
 
 		 216 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.356331 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1904  transcriptional regulator NarL  80.56 
 
 		 216 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1898  transcriptional regulator NarL  80.56 
 
 		 216 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.335981 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1556  transcriptional regulator NarL  80.56 
 
 		 216 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.109518 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2318  transcriptional regulator NarL  79.44 
 
 		 216 aa  304  8.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2223  transcriptional regulator NarL  68.87 
 
 		 221 aa  287  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134159  normal  0.207388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2299  transcriptional regulator NarL  68.4 
 
 		 221 aa  285  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.590018  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  61.68 
 
 		 219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  56.73 
 
 		 217 aa  244  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  59.13 
 
 		 219 aa  237  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  59.13 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1399  transcriptional regulator NarL  53.85 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  52.63 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5955  two component LuxR family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 215 aa  197  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5911  two component LuxR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 219 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1006  two component LuxR family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1951  putative nitrate/nitrite response regulator; NarL  52.15 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120802  normal  0.965323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0663  two component LuxR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  47.57 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  46.45 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2637  two component LuxR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0573022  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 209 aa  185  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2794  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  44.5 
 
 		 209 aa  185  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  44.5 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2472  transcriptional regulator NarP  46.12 
 
 		 215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  46.12 
 
 		 215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  46.12 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  46.12 
 
 		 215 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  46.12 
 
 		 215 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167087 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  46.12 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  46.12 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  46.12 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  46.12 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  46.12 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  46.12 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  46.12 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  46.12 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1736  DNA-binding response regulator NarL  45.41 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2764  DNA-binding response regulator NarL  45.41 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2246  DNA-binding response regulator NarL  45.41 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3072  DNA-binding response regulator NarL  45.41 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2630  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  45.41 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2686  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  45.41 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1519  DNA-binding response regulator NarL  45.41 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.281442  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1466  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.12 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25338  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1849  DNA-binding response regulator NarL  44.95 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00236991  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 217 aa  175  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2370  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  45.27 
 
 		 203 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000161759  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000464283  hitchhiker  0.00000781977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0792  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000151034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3836  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000136397  normal  0.0231387 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  44.66 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0620  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  45.81 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000275655  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0929  two component LuxR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 209 aa  171  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000567962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0646  response regulator receiver protein  46.27 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0492071  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  42.92 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  43.2 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.71 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0970  two component LuxR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0307407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0657  two component LuxR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000493749  normal  0.229808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3365  two component LuxR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000651556  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0656  two component LuxR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000830399  normal  0.140804 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3982  DNA-binding nitrate/nitrite response regulator  44.83 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0842  two component LuxR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000336278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0683  two component LuxR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000388278  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2711  transcriptional regulator NarP  44.66 
 
 		 210 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281479  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2406  transcriptional regulator NarP  44.66 
 
 		 210 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0424  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.19 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0433  two component LuxR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 208 aa  164  9e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0613  nitrate/nitrite response regulator NarP  43.96 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  40.38 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.07 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>