More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1153 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
243 aa  499  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1819  putative transcriptional regulator  49.79 
 
 
243 aa  218  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145412  normal  0.357363 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1815  putative transcriptional regulator  39.08 
 
 
265 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319475  normal  0.33301 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
242 aa  85.9  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
230 aa  85.5  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  29.69 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.69 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  29.69 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  29.69 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3840  transcriptional regulator, LuxR family  30.94 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  29.29 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2997  LuxR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.665573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  29.44 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2174  regulatory protein, LuxR  30 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4374  transcriptional regulator LuxR family  29.73 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  30.94 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  30.94 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0416  LuxR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2330  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  27.81 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  26.56 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0127  transcriptional regulator, LuxR family  29.03 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  23.39 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  29.79 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  32.31 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1266  DNA-binding transcriptional activator SdiA  25.4 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00315864  hitchhiker  0.00193945 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  26.06 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2015  DNA-binding transcriptional activator SdiA  25.4 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000284169  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1723  DNA-binding transcriptional activator SdiA  25.4 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00781439  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1730  transcriptional regulator, LuxR family  25.4 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000557622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2690  DNA-binding transcriptional activator SdiA  25.4 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.0383701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  35 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  27.54 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3140  regulatory protein LuxR  28.02 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2150  DNA-binding transcriptional activator SdiA  24.87 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1044  DNA-binding transcriptional activator SdiA  24.87 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000369866  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  56.92 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2311  LuxR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2503  DNA-binding transcriptional activator SdiA  26.88 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000339648  normal  0.514976 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  27.06 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  25.31 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  25.31 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0182  LuxR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
247 aa  65.1  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00268604  hitchhiker  0.00000585836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0720  LuxR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
247 aa  65.1  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0791  LuxR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
247 aa  65.1  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
244 aa  64.7  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  27.27 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2409  LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
272 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  25.54 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.35 
 
 
305 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4328  transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127099  normal  0.0225245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3147  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.86 
 
 
302 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2928  transcriptional regulator, LuxR family  26.69 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258432  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5012  regulatory protein, LuxR  30.11 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.136049 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  57.41 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2525  LuxR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.853805  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2667  transcriptional regulator, LuxR family  26.72 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.530563  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  50.82 
 
 
215 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  50.82 
 
 
215 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3665  LuxR family transcriptional regulator  60.38 
 
 
238 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3402  response regulator receiver protein  60.38 
 
 
238 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.511462  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  26.36 
 
 
245 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
309 aa  63.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.426964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
239 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
239 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
239 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  49.18 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  49.18 
 
 
215 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  25.53 
 
 
237 aa  62.8  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 
305 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1547  LuxR family transcriptional regulator  24.74 
 
 
245 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1715  LuxR family transcriptional regulator  24.74 
 
 
245 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  hitchhiker  0.000116776 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  42.5 
 
 
206 aa  62.8  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4558  LuxR family transcriptional regulator  24.66 
 
 
234 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534127  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2588  LuxR family transcriptional regulator  26 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1407  LuxR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
241 aa  62.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1655  LuxR family transcriptional regulator  24.74 
 
 
245 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3999  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
260 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117104  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1293  DNA-binding transcriptional activator SdiA  27.96 
 
 
240 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  hitchhiker  0.0000202879 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1817  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.95 
 
 
241 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.985291  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
309 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
247 aa  62.4  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.66 
 
 
228 aa  62.4  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2106  DNA-binding transcriptional activator SdiA  27.96 
 
 
240 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.010871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>