More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3665 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3665  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3402  response regulator receiver protein  98.74 
 
 		 238 aa  471  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.511462  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  29.19 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  26.11 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  26.11 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  29.19 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  24.37 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  28.73 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  25.45 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  25.45 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.2 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3796  LuxR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301827 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.2 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.2 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.2 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.2 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  27.54 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5699  LuxR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0607724 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1559  regulatory protein LuxR  33.53 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.08 
 
 		 394 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  30.57 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  30.57 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4558  LuxR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534127  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  28.26 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.69 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  22.5 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.26 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.26 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.07 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  60.38 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1927  LuxR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.48 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  28.09 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  26.91 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 235 aa  62  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1374  LuxR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  22.47 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  28.65 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  35.65 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2681  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.48 
 
 		 922 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2811  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206772  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  27.47 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  24.56 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.7 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0562  two component LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0475  transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 123 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282737  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  52.73 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  53.85 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  25.1 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0238  LuxR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0139  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  32.33 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3950  LuxR family DNA-binding response regulator  42.27 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331441  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  51.92 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0100  transcriptional regulator, LuxR family  27.54 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0318  transcriptional regulator, LuxR family  24.19 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1549  LuxR transcriptional regulator  51.92 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.152747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  26.92 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  50 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1869  two component LuxR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0791  LuxR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.77 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1501  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.74 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.138703 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0720  LuxR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  50.75 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0671  two component LuxR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 333 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  32.5 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3549  regulatory protein, LuxR  31.67 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0182  LuxR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00268604  hitchhiker  0.00000585836 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4980  LuxR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 1006 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>