More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5762 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  42.5 
 
 		 243 aa  205  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  42.08 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 243 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  43.03 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 241 aa  184  8e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2330  transcriptional regulator, LuxR family  38.56 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2174  regulatory protein, LuxR  38.56 
 
 		 240 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2311  LuxR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  32.92 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  38.82 
 
 		 243 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 246 aa  118  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  38.28 
 
 		 242 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 245 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7112  LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0985225  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  30.61 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4374  transcriptional regulator LuxR family  30.62 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3140  regulatory protein LuxR  29.11 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4299  LuxR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4980  LuxR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3180  LuxR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  24.17 
 
 		 248 aa  95.1  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  33.51 
 
 		 251 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  28.33 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  28.33 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3840  transcriptional regulator, LuxR family  31.06 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  34.95 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  27.94 
 
 		 307 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0416  LuxR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9665  two-component transcriptional regulator LuxR family  29.05 
 
 		 240 aa  88.6  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.024682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  29.83 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  31.05 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  31.05 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 268 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0097  transcriptional regulator, LuxR family  31.16 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  29.71 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.74 
 
 		 234 aa  85.5  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0440  regulatory protein LuxR  31.31 
 
 		 246 aa  85.1  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0539143 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  28.77 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49700  transcriptional regulator  29.49 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  30.48 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0287  transcriptional regulator, LuxR family  35.53 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  25.32 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.32 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.32 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4889  autoinducer-binding domain-containing protein  31.52 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70592  normal  0.843155 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  32.07 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  32.61 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  29.35 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2997  LuxR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.665573 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  28.45 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2507  LuxR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0318  transcriptional regulator, LuxR family  34.87 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2503  DNA-binding transcriptional activator SdiA  26.88 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000339648  normal  0.514976 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5910  LuxR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0531603  decreased coverage  0.00148471 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  28.25 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3348  transcriptional regulator, LuxR family  29 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  25.21 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  29.51 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  29.51 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.51 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  29.51 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8140  transcriptional regulator TraR  31.69 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692827  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8300  transcriptional regulator TraR  31.69 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2210  LuxR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0127  transcriptional regulator, LuxR family  28.04 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1649  transcriptional regulator RhlR  29.28 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.458186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>