More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0416 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0416  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 262 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0127  transcriptional regulator, LuxR family  74.07 
 
 		 206 aa  295  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 321 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 230 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 230 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  42.41 
 
 		 230 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  42.41 
 
 		 230 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  42.41 
 
 		 230 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.41 
 
 		 230 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 247 aa  93.2  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 242 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  30.05 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  31.07 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2330  transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 240 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  29.07 
 
 		 242 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2174  regulatory protein, LuxR  30.77 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31 
 
 		 425 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  26.82 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.13 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.13 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.13 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.13 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.13 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.13 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  31.68 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  29.33 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  31.68 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  29.33 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  31.25 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4889  autoinducer-binding domain-containing protein  29.87 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70592  normal  0.843155 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2525  LuxR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.853805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  32.81 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  30.73 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7112  LuxR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0985225  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  32.09 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  29.17 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  28.39 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1547  LuxR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1715  LuxR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  hitchhiker  0.000116776 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1655  LuxR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  29.89 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  25 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1407  LuxR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959158  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  28.05 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8140  transcriptional regulator TraR  26.79 
 
 		 227 aa  72  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692827  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8300  transcriptional regulator TraR  26.79 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3840  transcriptional regulator, LuxR family  25.86 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4509  autoinducer-binding domain-containing protein  27.04 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  26.92 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0097  transcriptional regulator, LuxR family  31.1 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  28.04 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  25.79 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1819  putative transcriptional regulator  28.93 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145412  normal  0.357363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  25.42 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  24.5 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  27.4 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4374  transcriptional regulator LuxR family  24.76 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4647  LuxR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 239 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  29.03 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  34.65 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9665  two-component transcriptional regulator LuxR family  24.79 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.024682  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  29.22 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2588  LuxR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0943  transcriptional regulator, LuxR family  29.53 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  49.21 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9195  transcriptional regulator TraR  25 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.391185  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4641  LuxR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.226579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  24.03 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1549  LuxR transcriptional regulator  54.24 
 
 		 201 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.152747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2973  LuxR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.207347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>