More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4279 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
321 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0416  LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 
262 aa  211  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0127  transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 
206 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  42.6 
 
 
230 aa  176  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  40.95 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  40.95 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  40.95 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40.95 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
242 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
244 aa  109  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
242 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
260 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  30.74 
 
 
243 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  30.68 
 
 
242 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  32.28 
 
 
307 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  28.51 
 
 
248 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.13 
 
 
238 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.13 
 
 
238 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.13 
 
 
425 aa  95.9  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.13 
 
 
238 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.13 
 
 
238 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.13 
 
 
238 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.3 
 
 
394 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
234 aa  95.5  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
247 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
234 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  30.53 
 
 
253 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2976  LuxR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
255 aa  92.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.575225 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4889  autoinducer-binding domain-containing protein  33.87 
 
 
233 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70592  normal  0.843155 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  28.51 
 
 
234 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  32.58 
 
 
243 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  32.58 
 
 
243 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0097  transcriptional regulator, LuxR family  31.85 
 
 
244 aa  90.1  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
245 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 
237 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 
237 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  28.73 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  30.08 
 
 
254 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1819  putative transcriptional regulator  31.75 
 
 
243 aa  86.7  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145412  normal  0.357363 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2525  LuxR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
276 aa  86.7  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.853805  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
229 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
231 aa  86.3  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
239 aa  86.3  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
239 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
239 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
239 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  26.91 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
239 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  28.57 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7112  LuxR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0985225  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  31.32 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1815  putative transcriptional regulator  31.49 
 
 
265 aa  84  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319475  normal  0.33301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  26.91 
 
 
239 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  32.02 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  31.32 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  31.02 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  29.36 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1649  transcriptional regulator RhlR  33.15 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.458186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19120  transcriptional regulator RhlR  33.15 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420854  normal  0.170234 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8140  transcriptional regulator TraR  26.03 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692827  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1655  LuxR family transcriptional regulator  27.04 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1547  LuxR family transcriptional regulator  27.04 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1715  LuxR family transcriptional regulator  27.04 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  hitchhiker  0.000116776 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8300  transcriptional regulator TraR  26.03 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  26.4 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
245 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  29.32 
 
 
237 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  27.89 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2667  transcriptional regulator, LuxR family  32.61 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.530563  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2588  LuxR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9195  transcriptional regulator TraR  25.55 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.391185  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  34.76 
 
 
233 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2928  transcriptional regulator, LuxR family  31.69 
 
 
241 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258432  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2997  LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.665573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  27.37 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2503  DNA-binding transcriptional activator SdiA  29.35 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000339648  normal  0.514976 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  33.69 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  33.69 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  26.18 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0791  LuxR family transcriptional regulator  23.15 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0182  LuxR family transcriptional regulator  23.15 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00268604  hitchhiker  0.00000585836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0720  LuxR family transcriptional regulator  23.15 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  28.18 
 
 
239 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.18 
 
 
239 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  28.18 
 
 
239 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  28.18 
 
 
239 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  28.18 
 
 
239 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  28.18 
 
 
239 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1559  regulatory protein LuxR  32.77 
 
 
246 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.509292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>