More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3796 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3796  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
237 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301827 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  25.11 
 
 
244 aa  111  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.8 
 
 
238 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.8 
 
 
238 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.8 
 
 
238 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.8 
 
 
238 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.8 
 
 
238 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.54 
 
 
425 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.54 
 
 
394 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
235 aa  101  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  28.51 
 
 
239 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  28.51 
 
 
239 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  28.51 
 
 
239 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  28.51 
 
 
239 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
235 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  28.51 
 
 
239 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  28.51 
 
 
239 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  28.51 
 
 
239 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.95 
 
 
239 aa  99.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  31.08 
 
 
236 aa  98.2  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  32.5 
 
 
254 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
239 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.23 
 
 
234 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
239 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
239 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
239 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
239 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  28.45 
 
 
234 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
234 aa  95.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
239 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  27.66 
 
 
237 aa  94  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  30.45 
 
 
237 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  30.45 
 
 
237 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  30.99 
 
 
243 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  29.61 
 
 
235 aa  92.4  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  29.3 
 
 
234 aa  91.7  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.3 
 
 
234 aa  91.7  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.3 
 
 
236 aa  91.7  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  28.92 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4980  LuxR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
237 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
248 aa  89.7  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4299  LuxR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
237 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3180  LuxR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
237 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  27.71 
 
 
234 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  27.6 
 
 
237 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1817  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.56 
 
 
241 aa  87  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.985291  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  27.6 
 
 
237 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  28.74 
 
 
245 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
260 aa  85.5  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1686  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28 
 
 
237 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0643903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28 
 
 
241 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2915  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28 
 
 
237 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2798  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28 
 
 
237 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.675669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2729  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28 
 
 
241 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0930619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2672  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28 
 
 
241 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2371  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28 
 
 
241 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440892  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  28.51 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  24.9 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  24.9 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5910  LuxR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0531603  decreased coverage  0.00148471 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  22.94 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  27.88 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  28.23 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5699  LuxR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0607724 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  24.88 
 
 
213 aa  79  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  29.77 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  35.09 
 
 
242 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  33.13 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  26.26 
 
 
247 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1833  LuxR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.873673  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4889  LuxR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.672367  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6376  transcriptional regulator, LuxR family  28.25 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.888984 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  27.39 
 
 
231 aa  72  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  24.75 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3273  transcriptional regulator LuxR family  29.41 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2997  LuxR family transcriptional regulator  44.57 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.665573 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  24.73 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  24.34 
 
 
307 aa  68.6  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  28.35 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6196  transcriptional regulator, LuxR family  26.86 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1730  transcriptional regulator, LuxR family  26.99 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000557622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0175  LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.508003  normal  0.575618 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1723  DNA-binding transcriptional activator SdiA  26.55 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00781439  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  25.52 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9665  two-component transcriptional regulator LuxR family  27.14 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.024682  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  26.75 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2015  DNA-binding transcriptional activator SdiA  26.55 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000284169  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  24.69 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2690  DNA-binding transcriptional activator SdiA  26.99 
 
 
240 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.0383701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  25.42 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  27.16 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>