More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29510 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29510  ATP-dependent transcriptional regulator  100 
 
 		 992 aa  1902    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.611914 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3120  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  28.44 
 
 		 854 aa  158  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36550  ATP-dependent transcriptional regulator  29.72 
 
 		 846 aa  102  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  29.81 
 
 		 916 aa  67.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  32.27 
 
 		 900 aa  65.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  32.63 
 
 		 824 aa  64.3  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.37 
 
 		 309 aa  63.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1432  regulatory protein, LuxR  36.09 
 
 		 837 aa  61.6  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164581 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.01 
 
 		 846 aa  61.2  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.15 
 
 		 766 aa  60.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 238 aa  60.1  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3217  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.17 
 
 		 891 aa  60.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000769208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 250 aa  60.1  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  29.32 
 
 		 887 aa  59.3  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  41.76 
 
 		 884 aa  59.7  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3844  regulatory protein, LuxR  31.14 
 
 		 944 aa  58.9  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0601  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  32.14 
 
 		 901 aa  58.9  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000493174 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  45.45 
 
 		 213 aa  58.9  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0745  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  49.18 
 
 		 895 aa  58.5  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0162  ATP-dependent transcriptional regulator-like  29.19 
 
 		 756 aa  58.2  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  45 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  45.71 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  45 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 221 aa  57.4  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0923  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50 
 
 		 1235 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0655  two component LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 194 aa  57.4  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0618  transcriptional regulator, LuxR family  46.97 
 
 		 196 aa  57.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3743  transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 286 aa  57.4  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.38 
 
 		 208 aa  56.6  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26890  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.24 
 
 		 515 aa  56.6  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 217 aa  56.6  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.9 
 
 		 930 aa  57  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5618  ATP-dependent transcription regulator LuxR  47.69 
 
 		 1383 aa  57  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.586723 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 253 aa  57  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0881  transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 266 aa  56.6  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4084  two component LuxR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 246 aa  56.6  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  45.31 
 
 		 911 aa  56.2  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1523  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  44.44 
 
 		 873 aa  56.2  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4871  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 222 aa  56.2  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134443  normal  0.31614 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 904 aa  55.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.03 
 
 		 223 aa  56.6  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.253855  normal  0.0592312 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 303 aa  56.2  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  30.1 
 
 		 933 aa  55.8  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4449  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 253 aa  55.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.83 
 
 		 867 aa  55.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03170  ATP-dependent transcriptional regulator  37.11 
 
 		 868 aa  55.5  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  47.37 
 
 		 285 aa  55.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 214 aa  55.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0659  transcriptional regulator FimZ  34.86 
 
 		 210 aa  55.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  44.26 
 
 		 917 aa  55.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0602  transcriptional regulator FimZ  34.86 
 
 		 210 aa  55.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.0923244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 461 aa  55.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 253 aa  55.1  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0594  transcriptional regulator FimZ  34.86 
 
 		 210 aa  55.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627077  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04700  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.44 
 
 		 198 aa  55.1  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.162406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2289  regulatory protein LuxR  31.11 
 
 		 151 aa  54.7  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6539  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.44 
 
 		 198 aa  54.7  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6441  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 227 aa  54.7  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.6 
 
 		 910 aa  54.7  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 213 aa  54.3  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3022  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  44.23 
 
 		 485 aa  54.3  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.709367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  41.67 
 
 		 242 aa  54.3  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  31.71 
 
 		 913 aa  54.3  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 270 aa  53.9  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  44.12 
 
 		 227 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 781 aa  54.3  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.86 
 
 		 1019 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 210 aa  54.3  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 221 aa  54.3  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  53.9  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3120  response regulator receiver  47.62 
 
 		 212 aa  53.9  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.230577  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 217 aa  53.9  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0487  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 215 aa  53.9  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2532  transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 500 aa  53.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 234 aa  53.5  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.18 
 
 		 924 aa  53.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0029  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  53.5  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268532  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23170  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.7 
 
 		 474 aa  53.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.23412 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 220 aa  53.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 206 aa  53.5  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1088  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 207 aa  53.5  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  35.71 
 
 		 891 aa  53.5  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  44.26 
 
 		 896 aa  53.5  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  45.45 
 
 		 1003 aa  53.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3839  regulatory protein, LuxR  44.12 
 
 		 268 aa  53.5  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  41.18 
 
 		 914 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0502  regulatory protein, LuxR  47.54 
 
 		 861 aa  53.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0169233  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1565  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 214 aa  53.5  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03730  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.28 
 
 		 426 aa  52.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.532687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.16 
 
 		 911 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2485  transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 316 aa  52.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1210  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 198 aa  53.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  43.66 
 
 		 220 aa  53.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5235  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 134 aa  52.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183919  normal  0.452557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  42.03 
 
 		 471 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.74 
 
 		 230 aa  52.8  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 212 aa  52.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>