More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0659 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0659  transcriptional regulator FimZ  100 
 
 		 210 aa  426  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0594  transcriptional regulator FimZ  100 
 
 		 210 aa  426  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627077  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0602  transcriptional regulator FimZ  100 
 
 		 210 aa  426  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.0923244 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0598  transcriptional regulator FimZ  99.52 
 
 		 210 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0595  transcriptional regulator FimZ  99.52 
 
 		 210 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0993  transcriptional regulator FimZ  76.19 
 
 		 210 aa  332  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287084 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00485  predicted DNA-binding transcriptional regulator  71.9 
 
 		 210 aa  317  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3078  two component transcriptional regulator, LuxR family  71.9 
 
 		 210 aa  317  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00490  hypothetical protein  71.9 
 
 		 210 aa  317  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0636  transcriptional regulator FimZ  71.9 
 
 		 210 aa  317  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.931873  normal  0.250092 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0577  transcriptional regulator FimZ  71.9 
 
 		 210 aa  317  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0610  transcriptional regulator FimZ  71.9 
 
 		 210 aa  317  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3087  transcriptional regulator FimZ  71.9 
 
 		 210 aa  317  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0580  transcriptional regulator FimZ  71.43 
 
 		 210 aa  315  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0462  transcriptional regulator FimZ  70.68 
 
 		 199 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.739138  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2160  LuxR family DNA-binding response regulator  47.39 
 
 		 210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2269  two component LuxR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2113  LuxR family DNA-binding response regulator  46.92 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12780  putative two-component response regulator  43.75 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1160  putative two-component response regulator  42.79 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5714  two component LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1119  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4470  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 232 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370568  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4331  two component LuxR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 212 aa  160  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.748519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2114  LuxR response regulator receiver  39.05 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24710  putative two-component response regulator  40.76 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2093  putative two-component response regulator  40.76 
 
 		 207 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0036  putative two-component response regulator  40.58 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.035019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00430  putative two-component response regulator  40.58 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.247974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.796271  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1090  LuxR family DNA-binding response regulator  38.35 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4151  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.71 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35782  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3890  LuxR response regulator receiver  36.71 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1620  two component LuxR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0222153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4515  two component LuxR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2101  LuxR family DNA-binding response regulator  36.19 
 
 		 207 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00862279  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3638  two component LuxR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 205 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4322  two component LuxR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.003137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3974  two component LuxR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0174  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.07 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6866  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 202 aa  148  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140006  normal  0.169631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4334  two component LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 209 aa  148  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6883  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239531  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2928  two component LuxR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0522  LuxR response regulator receiver  37.75 
 
 		 212 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000276468  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5940  LuxR family response regulator  35.71 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000781929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 207 aa  144  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5536  LuxR response regulator receiver  35.41 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.882777  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2906  two component LuxR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2781  two component LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07840  putative two-component response regulator  36.02 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0171986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0745  putative two-component response regulator  35.55 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02279  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with EvgS  32.2 
 
 		 204 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1288  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.2 
 
 		 204 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02240  hypothetical protein  32.2 
 
 		 204 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1300  DNA-binding transcriptional activator EvgA  32.2 
 
 		 204 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2519  DNA-binding transcriptional activator EvgA  32.2 
 
 		 204 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2655  DNA-binding transcriptional activator EvgA  32.2 
 
 		 204 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3600  DNA-binding transcriptional activator EvgA  32.2 
 
 		 204 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0441797 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2506  DNA-binding transcriptional activator EvgA  32.2 
 
 		 204 aa  132  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00265649  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 209 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2738  DNA-binding transcriptional activator EvgA  32.2 
 
 		 204 aa  131  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1369  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.27 
 
 		 218 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 213 aa  127  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  34.6 
 
 		 209 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0459  two component LuxR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  34.6 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2528  two component LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1775  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.814588  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1286  two component LuxR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2237  two component LuxR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.98 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.2 
 
 		 211 aa  121  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  33.03 
 
 		 234 aa  121  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  33.96 
 
 		 282 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  33.96 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  33.96 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  33.96 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  33.96 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  33.96 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0849  two component LuxR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 		 218 aa  118  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 226 aa  118  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  33.65 
 
 		 215 aa  118  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2350  two component LuxR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 204 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>