168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36550 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36550  ATP-dependent transcriptional regulator  100 
 
 		 846 aa  1641    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3120  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  30.31 
 
 		 854 aa  206  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29510  ATP-dependent transcriptional regulator  28.05 
 
 		 992 aa  88.6  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.611914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  26.22 
 
 		 914 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03170  ATP-dependent transcriptional regulator  32.27 
 
 		 868 aa  82  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3217  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  25.24 
 
 		 891 aa  80.1  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000769208 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4102  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  24.49 
 
 		 859 aa  72.8  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.77 
 
 		 913 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  23.37 
 
 		 901 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  23.37 
 
 		 901 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  23.37 
 
 		 901 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.43 
 
 		 914 aa  69.3  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  23.37 
 
 		 902 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  23.37 
 
 		 901 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.25 
 
 		 910 aa  67  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  22.29 
 
 		 903 aa  65.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  22.29 
 
 		 903 aa  65.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  26.88 
 
 		 933 aa  65.1  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  22.22 
 
 		 901 aa  63.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  23.06 
 
 		 904 aa  62  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  22.29 
 
 		 901 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  22.29 
 
 		 901 aa  61.2  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  22.29 
 
 		 901 aa  61.2  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  22.29 
 
 		 901 aa  61.2  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  22.29 
 
 		 901 aa  61.2  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  22.29 
 
 		 901 aa  60.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  25.58 
 
 		 884 aa  60.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  20.05 
 
 		 902 aa  60.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  22.29 
 
 		 901 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  28.1 
 
 		 749 aa  59.7  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  22.29 
 
 		 901 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  20.96 
 
 		 902 aa  59.3  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.71 
 
 		 889 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1088  transcriptional regulator, LuxR family  48.44 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3844  regulatory protein, LuxR  28.85 
 
 		 944 aa  58.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.69 
 
 		 880 aa  57.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2176  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.65 
 
 		 888 aa  57.8  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.250716 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  23.54 
 
 		 896 aa  57  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  24.76 
 
 		 896 aa  57.4  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6539  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 198 aa  56.6  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4199  regulatory protein, LuxR  30.94 
 
 		 855 aa  56.6  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3567  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.73 
 
 		 251 aa  56.2  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  45.83 
 
 		 846 aa  55.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04700  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.33 
 
 		 198 aa  56.2  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.162406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 914 aa  55.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1210  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 198 aa  55.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0487  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 215 aa  55.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 461 aa  55.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0745  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  45.16 
 
 		 895 aa  54.7  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0047  transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 80 aa  53.5  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.284313  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25 
 
 		 932 aa  53.9  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3839  regulatory protein, LuxR  46.15 
 
 		 268 aa  54.3  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  34.3 
 
 		 766 aa  53.9  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3636  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.94 
 
 		 953 aa  53.9  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0377  transcriptional regulator, LuxR family  33.63 
 
 		 134 aa  52.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0096  transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 78 aa  53.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 270 aa  53.5  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1524  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  36.09 
 
 		 907 aa  53.5  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.64 
 
 		 911 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2342  response regulator receiver  47.54 
 
 		 212 aa  52.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  46.27 
 
 		 1003 aa  52.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  48.39 
 
 		 221 aa  52.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 221 aa  52.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4745  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 209 aa  51.6  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5235  transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 134 aa  51.6  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183919  normal  0.452557 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0029  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 220 aa  51.6  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268532  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0365  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 199 aa  51.6  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.210231  normal  0.243335 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0182  transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 85 aa  51.2  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 253 aa  51.2  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0601  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  29.47 
 
 		 901 aa  51.2  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000493174 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4449  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 253 aa  51.2  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.62 
 
 		 1019 aa  51.2  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5374  two component response regulator  33.68 
 
 		 779 aa  50.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4809  regulatory protein, LuxR  32.82 
 
 		 717 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2088  transcriptional regulator, LuxR family  34.82 
 
 		 135 aa  50.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 921 aa  50.1  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  27.58 
 
 		 894 aa  49.7  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  24.4 
 
 		 916 aa  50.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  22.85 
 
 		 1055 aa  50.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4871  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 222 aa  49.7  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134443  normal  0.31614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4386  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 214 aa  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5618  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.76 
 
 		 1383 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.586723 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0923  ATP-dependent transcription regulator LuxR  52.08 
 
 		 1235 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3710  LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 426 aa  49.3  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0730  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 214 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2814  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 214 aa  49.3  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  43.55 
 
 		 471 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 216 aa  48.9  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3664  regulatory protein, LuxR  48.39 
 
 		 215 aa  48.9  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 217 aa  48.5  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2814  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 146 aa  48.1  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 454 aa  48.5  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  48.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  24.84 
 
 		 905 aa  48.1  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.01 
 
 		 309 aa  48.1  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3564  MalT  29.41 
 
 		 695 aa  48.1  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.21 
 
 		 213 aa  47.8  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.8 
 
 		 900 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  22.52 
 
 		 913 aa  47.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0766  tetratricopeptide TPR_4  25.69 
 
 		 1000 aa  47.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>