37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6468 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6468  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 259 aa  158  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 284 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2210  LuxR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2602  regulatory protein, LuxR  33.08 
 
 		 268 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.718  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  32.97 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2607  regulatory protein, LuxR  32.73 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0221488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  32.84 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2578  regulatory protein, LuxR  42.34 
 
 		 226 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2833  transcriptional regulator, LuxR family  46.21 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2828  transcriptional regulator SyrR  32.06 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00104787  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 284 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 269 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  27.69 
 
 		 272 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 204 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6161  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  decreased coverage  0.000109123 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 269 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0443  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 213 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0392  transcriptional regulator, LuxR family  34.34 
 
 		 529 aa  43.1  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 272 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  34.12 
 
 		 213 aa  42.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  34.12 
 
 		 213 aa  42.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>