44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2607 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2607  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 276 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0221488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2210  LuxR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 264 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2602  regulatory protein, LuxR  48.46 
 
 		 268 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.718  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  42.42 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2828  transcriptional regulator SyrR  41 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00104787  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6468  LuxR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 271 aa  95.5  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  28.16 
 
 		 284 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 276 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 294 aa  85.9  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2833  transcriptional regulator, LuxR family  27.52 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2578  regulatory protein, LuxR  27.04 
 
 		 226 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1880  LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2759  response regulator receiver protein  40 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550861  normal  0.145492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1337  regulatory protein, LuxR  36.67 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2327  regulatory protein, LuxR  40 
 
 		 210 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1517  transcriptional regulator, LuxR family protein  38.89 
 
 		 210 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.776537  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 272 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1726  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  42.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.474249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2386  LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 211 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1446  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 210 aa  42.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0398792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2316  LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 211 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 269 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2509  LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 211 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592216  hitchhiker  0.00000482381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2332  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 211 aa  42.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2725  LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 211 aa  42.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 272 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 201 aa  42  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1832  LuxR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 211 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1788  response regulator receiver protein  26.62 
 
 		 211 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1796  response regulator receiver protein  26.62 
 
 		 211 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2490  transcriptional regulator, LuxR family  26.62 
 
 		 211 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>