61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1446 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  100 
 
 		 284 aa  579  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1172  LuxR family transcriptional regulator  26 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  34.81 
 
 		 268 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4862  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2821  LuxR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.842744  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10980  hypothetical protein  26.64 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0774  regulatory protein, LuxR  25.85 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  23.25 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  29.32 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6468  LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 296 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4239  regulatory protein, LuxR  25 
 
 		 312 aa  49.7  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 262 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  26.14 
 
 		 257 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  30.36 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1565  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.92 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3388  two-component response regulator transcription regulator protein  40.85 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0201761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2833  transcriptional regulator, LuxR family  27.2 
 
 		 222 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2602  regulatory protein, LuxR  38.46 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.718  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 204 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2578  regulatory protein, LuxR  26.92 
 
 		 226 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  24.55 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2086  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 220 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4633  response regulator receiver protein  21.32 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2607  regulatory protein, LuxR  37.31 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0221488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2210  LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1662  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214082  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  25.9 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3079  two component LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 219 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  21.83 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 262 aa  42.7  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 856 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0474  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 211 aa  42.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1607  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 236 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 219 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2828  transcriptional regulator SyrR  42.59 
 
 		 257 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00104787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 219 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 219 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 210 aa  42.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>