34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0774 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0774  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 242 aa  483  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  27.31 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 262 aa  62  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4633  response regulator receiver protein  25.84 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 268 aa  55.1  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4862  response regulator receiver protein  45.59 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2821  LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.842744  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 284 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 285 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1854  LuxR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1172  LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4239  regulatory protein, LuxR  23.11 
 
 		 312 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10980  hypothetical protein  50 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2578  regulatory protein, LuxR  35 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10861  nitrate/nitrite response transcriptional regulatory protein narL  40.98 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000061441 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4114  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.71 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0576718  normal  0.109105 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2342  response regulator receiver  36.76 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4782  transcriptional regulator, LuxR family  28.21 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1122  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 234 aa  42.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.752968  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 210 aa  42  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 288 aa  41.6  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>