172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1220 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  92.96 
 
 		 272 aa  520  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  61.62 
 
 		 272 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  61.71 
 
 		 269 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  61.34 
 
 		 269 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  56.18 
 
 		 272 aa  292  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  65.2 
 
 		 204 aa  261  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4782  transcriptional regulator, LuxR family  32.2 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4633  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 290 aa  85.5  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10980  hypothetical protein  29.91 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2821  LuxR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.842744  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  27.51 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4862  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  27.89 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  26.19 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0774  regulatory protein, LuxR  30.43 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 257 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  27.95 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  23.32 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4239  regulatory protein, LuxR  27.13 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  23.64 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 276 aa  52.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1260  LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  37 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0143  transcription regulator  44.44 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0190  transcription regulator  44.44 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.56 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 267 aa  49.3  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 301 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 272 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 272 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 272 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 263 aa  49.3  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0618  LuxR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2828  transcriptional regulator SyrR  42.86 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00104787  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2674  DNA-binding response regulator  35.53 
 
 		 210 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0443  two component LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  26.22 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  27.83 
 
 		 899 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 882 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  26.57 
 
 		 550 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  23.3 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0333  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 141 aa  46.6  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.800894  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3796  LuxR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 237 aa  46.6  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6705  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318103  normal  0.0731204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1668  response regulator receiver  35 
 
 		 222 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1985  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 222 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 272 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3790  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 226 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1172  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2114  LuxR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 435 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  34.44 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>