236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2114 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1472  LuxR family transcriptional regulator  92.1 
 
 
382 aa  691    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.659307  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2488  LuxR family transcriptional regulator  92.37 
 
 
382 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2114  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
435 aa  888    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1965  LuxR family transcriptional regulator  89.05 
 
 
465 aa  756    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.701067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3340  LuxR family transcriptional regulator  92.08 
 
 
381 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0323949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2331  LuxR family transcriptional regulator  92.35 
 
 
381 aa  690    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2372  LuxR family transcriptional regulator  92.08 
 
 
381 aa  688    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1239  LuxR family transcriptional regulator  92.08 
 
 
381 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1916  LuxR family transcriptional regulator  76.74 
 
 
381 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309306  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5229  LuxR family transcriptional regulator  78.24 
 
 
381 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1951  LuxR family transcriptional regulator  75.94 
 
 
381 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6151  LuxR family transcriptional regulator  78.37 
 
 
381 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1928  LuxR family transcriptional regulator  78.37 
 
 
381 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1344  LuxR family transcriptional regulator  76.86 
 
 
381 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459414  normal  0.0284977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1819  LuxR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
339 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1345  putative transcriptional regulator  29.17 
 
 
325 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1549  LuxR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
367 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.730444  normal  0.517994 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4266  regulatory protein, LuxR  31.66 
 
 
330 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15290  putative transcriptional regulator  28.71 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0074929  hitchhiker  0.0000000000000265262 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5017  transcriptional regulator, LuxR family  29.91 
 
 
326 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2336  LuxR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
322 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0159  LuxR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1577  LuxR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
340 aa  96.3  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0869  response regulator  23.47 
 
 
321 aa  89.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2811  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.1 
 
 
217 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  46.3 
 
 
285 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0664  LuxR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
360 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 
938 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 
215 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.96 
 
 
212 aa  50.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.32 
 
 
216 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
936 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
250 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1432  regulatory protein, LuxR  35.9 
 
 
837 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164581 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 
920 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  43.14 
 
 
206 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13460  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.29 
 
 
472 aa  48.9  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2341  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 
209 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.193906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
243 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
228 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
209 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
251 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
251 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  40.38 
 
 
884 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
242 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5833  LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
489 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
231 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6289  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
515 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  32.76 
 
 
940 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 
1085 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  34.92 
 
 
946 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 
219 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0930  LuxR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
246 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6214  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0405  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
218 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
243 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3769  transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 
205 aa  47.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0158689  normal  0.601222 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3818  LuxR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
264 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 
947 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  36.36 
 
 
226 aa  47.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33920  putative transcriptional regulator  38.6 
 
 
213 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.100556  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6044  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 
226 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.93 
 
 
227 aa  47  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 
840 aa  47  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
230 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2786  two component LuxR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
210 aa  46.6  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0443035  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.19 
 
 
247 aa  46.6  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
208 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 
211 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 
217 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 
238 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3179  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 
229 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 
229 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2104  LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
235 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
243 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
268 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2998  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 
228 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
225 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13440  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  37.25 
 
 
509 aa  46.2  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 
250 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2216  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
211 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00683516  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2084  LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 
288 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 
210 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 
1137 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3748  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.37 
 
 
236 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
225 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 
220 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 
211 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  35.85 
 
 
227 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
219 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
263 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
272 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  34.25 
 
 
919 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.93 
 
 
229 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6457  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 
570 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6692  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 
570 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 
206 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 
209 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 
226 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 
226 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  35.09 
 
 
917 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>