194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2336 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2336  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 322 aa  652    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5017  transcriptional regulator, LuxR family  56.96 
 
 		 326 aa  354  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1819  LuxR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0159  LuxR family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655678 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1916  LuxR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1345  putative transcriptional regulator  31.83 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15290  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 325 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0074929  hitchhiker  0.0000000000000265262 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2114  LuxR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 435 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1344  LuxR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 381 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459414  normal  0.0284977 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1472  LuxR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 382 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.659307  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2488  LuxR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 382 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3340  LuxR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 381 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0323949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1239  LuxR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 381 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2331  LuxR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 381 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1965  LuxR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 465 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.701067  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2372  LuxR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 381 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6151  LuxR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 381 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1928  LuxR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 381 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5229  LuxR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 381 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1951  LuxR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 381 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4266  regulatory protein, LuxR  30.22 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1549  LuxR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.730444  normal  0.517994 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0869  response regulator  25.89 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1577  LuxR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 680 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1621  capsular synthesis response regulator transcription regulator protein  33.98 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7042  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 1085 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3529  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 324 aa  49.3  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0405  two component LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 218 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3452  transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 227 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  hitchhiker  0.00000787423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  41.24 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6247  transcriptional regulator, LuxR family  30.99 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.670073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  36.63 
 
 		 209 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.71 
 
 		 253 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 368 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3421  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 204 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 213 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  34.04 
 
 		 824 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 175 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 176 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 178 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 209 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 178 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  30 
 
 		 879 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 208 aa  47  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_002936  DET1144  DNA-binding response regulator  40.82 
 
 		 247 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 886 aa  46.6  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 209 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02400  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.07 
 
 		 255 aa  46.6  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2065  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  51.06 
 
 		 838 aa  46.2  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  47.92 
 
 		 285 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2104  LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 235 aa  46.2  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2765  LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 77 aa  46.2  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 257 aa  45.8  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  39.78 
 
 		 977 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 956 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  36.78 
 
 		 953 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0029  two component LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.08 
 
 		 922 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0565  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4005  response regulator receiver protein  36.92 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  46.94 
 
 		 916 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4699  two component LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 246 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372391  hitchhiker  0.00465492 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 189 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  48.28 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000126323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00485  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.33 
 
 		 210 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3078  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.33 
 
 		 210 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0580  transcriptional regulator FimZ  31.33 
 
 		 210 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1484  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.05 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  40.38 
 
 		 496 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0143  transcription regulator  48.94 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 938 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0636  transcriptional regulator FimZ  31.33 
 
 		 210 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.931873  normal  0.250092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3087  transcriptional regulator FimZ  31.33 
 
 		 210 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  44.23 
 
 		 588 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6284  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.68 
 
 		 192 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0610  transcriptional regulator FimZ  31.33 
 
 		 210 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0190  transcription regulator  48.94 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  42.55 
 
 		 119 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0730  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 214 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4040  two component LuxR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>