286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2065 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2065  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  100 
 
 
838 aa  1743    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27.93 
 
 
839 aa  265  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0621  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  24.76 
 
 
824 aa  251  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000506024  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1080  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  24.41 
 
 
823 aa  191  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.94 
 
 
876 aa  111  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.13 
 
 
880 aa  94.7  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  23.76 
 
 
897 aa  93.2  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  24.02 
 
 
887 aa  92.4  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.23 
 
 
766 aa  90.9  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  21.41 
 
 
910 aa  90.1  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.2 
 
 
1021 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  23.28 
 
 
916 aa  88.2  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  21.62 
 
 
913 aa  87.4  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  21.27 
 
 
914 aa  85.5  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  23.41 
 
 
846 aa  83.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.43 
 
 
870 aa  82.8  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  23.26 
 
 
900 aa  81.6  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  23.3 
 
 
1204 aa  79.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3120  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  22.96 
 
 
854 aa  79  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  22.47 
 
 
1003 aa  78.2  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  24.2 
 
 
900 aa  78.2  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  23.4 
 
 
1163 aa  76.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1524  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.18 
 
 
907 aa  76.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179507  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  22.14 
 
 
921 aa  75.9  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  23.16 
 
 
947 aa  74.3  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  20.83 
 
 
867 aa  73.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  22.09 
 
 
1145 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.19 
 
 
884 aa  73.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  24.57 
 
 
904 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.38 
 
 
758 aa  72.8  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.34 
 
 
922 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  24.88 
 
 
1111 aa  72  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  23 
 
 
910 aa  71.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  20.54 
 
 
894 aa  71.6  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.98 
 
 
930 aa  71.2  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  24.92 
 
 
907 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  22.69 
 
 
1095 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  23.54 
 
 
906 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.44 
 
 
921 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.44 
 
 
921 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  21.53 
 
 
749 aa  69.3  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  21.76 
 
 
914 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.6 
 
 
930 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  22.36 
 
 
901 aa  68.6  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.32 
 
 
925 aa  68.2  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  21.83 
 
 
901 aa  67.8  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  20.62 
 
 
902 aa  67.4  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.02 
 
 
877 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  22.82 
 
 
906 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0292  hypothetical protein  22.87 
 
 
954 aa  66.6  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0090168  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  20.77 
 
 
900 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0766  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27.88 
 
 
840 aa  64.3  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310851  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  22.76 
 
 
920 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  22.19 
 
 
960 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.54 
 
 
913 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1633  regulatory protein, LuxR  22.65 
 
 
732 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.72 
 
 
911 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  20.92 
 
 
902 aa  63.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  22.1 
 
 
919 aa  63.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0921  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  23.04 
 
 
881 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54574  normal  0.164383 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  20.66 
 
 
913 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0105  transcriptional regulator domain protein  23.79 
 
 
969 aa  62  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3827  transcriptional regulator domain-containing protein  23.25 
 
 
1102 aa  62  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0262799 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  21.56 
 
 
1061 aa  61.6  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  21.59 
 
 
905 aa  61.2  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.34 
 
 
900 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  23.86 
 
 
1094 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1523  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  23.78 
 
 
873 aa  60.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.6 
 
 
921 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0954  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
993 aa  60.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.656775  normal  0.653362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.77 
 
 
1019 aa  59.3  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5034  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  20.99 
 
 
935 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314145  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.68 
 
 
914 aa  58.5  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  25.32 
 
 
907 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  21.86 
 
 
917 aa  58.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0140  ATP-dependent transcriptional regulator  23.13 
 
 
977 aa  58.2  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  20.24 
 
 
1082 aa  57.4  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  64.44 
 
 
216 aa  56.6  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  25.45 
 
 
901 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  19.61 
 
 
904 aa  56.6  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0692  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.2 
 
 
213 aa  56.6  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  20.6 
 
 
921 aa  56.6  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2281  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  22.6 
 
 
730 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.67 
 
 
924 aa  56.6  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  25 
 
 
901 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4082  regulatory protein, LuxR  20.67 
 
 
888 aa  55.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.566011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  25.45 
 
 
901 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  25 
 
 
901 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  25.45 
 
 
902 aa  56.2  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  25 
 
 
901 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.84 
 
 
905 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  25 
 
 
901 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  25.45 
 
 
901 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  25 
 
 
901 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  19.95 
 
 
896 aa  55.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  25.45 
 
 
901 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  25 
 
 
901 aa  55.8  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  25 
 
 
901 aa  55.8  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  22.43 
 
 
907 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  22.22 
 
 
896 aa  55.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>