114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1577 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1577  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 340 aa  684    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0159  LuxR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 381 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655678 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1344  LuxR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459414  normal  0.0284977 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5229  LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1916  LuxR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1951  LuxR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 381 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6151  LuxR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 381 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1928  LuxR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 381 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2114  LuxR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 435 aa  96.3  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1345  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15290  putative transcriptional regulator  27.67 
 
 		 325 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0074929  hitchhiker  0.0000000000000265262 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1965  LuxR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 465 aa  89.4  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.701067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3340  LuxR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 381 aa  89.4  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0323949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1239  LuxR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 381 aa  89.4  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1472  LuxR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 382 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.659307  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2488  LuxR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 382 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2372  LuxR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 381 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2331  LuxR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4266  regulatory protein, LuxR  27.05 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1819  LuxR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 339 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1549  LuxR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.730444  normal  0.517994 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2336  LuxR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5017  transcriptional regulator, LuxR family  23.85 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 910 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0132  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 196 aa  49.7  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.401597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3504  DNA-binding transcriptional activator UhpA  40.62 
 
 		 196 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3378  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 249 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.394495  normal  0.0844825 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37 
 
 		 201 aa  47  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.666199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2084  LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 288 aa  46.6  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  36.14 
 
 		 880 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0081  two component LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 196 aa  46.6  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 215 aa  46.2  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  45.45 
 
 		 903 aa  46.2  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03553  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system wtih UhpB  46.43 
 
 		 196 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0034  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 196 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3291  response regulator receiver domain-containing protein  45.61 
 
 		 592 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1403  hypothetical protein  35.82 
 
 		 252 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  26.02 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0514  LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 206 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 176 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4080  transcriptional regulatory protein UhpA  46.3 
 
 		 196 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3882  DNA-binding transcriptional activator UhpA  46.43 
 
 		 196 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4178  DNA-binding transcriptional activator UhpA  46.43 
 
 		 196 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4132  two-component system response regulator  46.3 
 
 		 196 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2996  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 595 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.896317  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0030  DNA-binding transcriptional activator UhpA  46.43 
 
 		 196 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4034  DNA-binding transcriptional activator UhpA  46.43 
 
 		 196 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383338 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4250  DNA-binding transcriptional activator UhpA  46.43 
 
 		 196 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4071  DNA-binding transcriptional activator UhpA  46.43 
 
 		 196 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4121  DNA-binding transcriptional activator UhpA  46.43 
 
 		 196 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4000  DNA-binding transcriptional activator UhpA  46.43 
 
 		 196 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.348805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4016  DNA-binding transcriptional activator UhpA  46.43 
 
 		 196 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4179  DNA-binding transcriptional activator UhpA  46.43 
 
 		 196 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5099  DNA-binding transcriptional activator UhpA  46.43 
 
 		 196 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0828785 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3228  Two-component protein Kinase  45.61 
 
 		 595 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  45.61 
 
 		 595 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03495  hypothetical protein  46.43 
 
 		 196 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 175 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7377  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 216 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  33.66 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 178 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 213 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 178 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.8 
 
 		 211 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2754  two component LuxR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 215 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221671  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1236  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 208 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.23752  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0405  two component LuxR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 218 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1980  two component LuxR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 226 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.893627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 215 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0184  transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 507 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  37.5 
 
 		 893 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2846  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 215 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.243379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  38.18 
 
 		 200 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2938  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 215 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01760  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.34 
 
 		 546 aa  44.7  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000265618 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7042  LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 237 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 913 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1766  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 203 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00488071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0906  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 208 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000244022  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 201 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 192 aa  43.5  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 200 aa  43.5  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 200 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  31.25 
 
 		 839 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 881 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 881 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 876 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 200 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 200 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 200 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 200 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 200 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30650  response regulator GacA  37.68 
 
 		 214 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2613  response regulator GacA  37.68 
 
 		 214 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2765  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 77 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 200 aa  43.1  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 201 aa  43.1  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 200 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>