286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2765 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2765  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 77 aa  161  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  47.83 
 
 		 268 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  47.83 
 
 		 268 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 940 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 245 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 272 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 228 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 263 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0405  two component LuxR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 218 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 272 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 272 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3534  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.1 
 
 		 206 aa  47  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 272 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1819  LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 339 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2336  LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 322 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2846  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 215 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.243379  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2754  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 215 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 895 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5308  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.4 
 
 		 397 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.418046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 258 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2938  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 215 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 217 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 215 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 268 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4084  two component LuxR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 246 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.1 
 
 		 204 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  42.59 
 
 		 220 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  44.64 
 
 		 894 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5017  transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 326 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2811  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 217 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206772  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 220 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2723  transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 509 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.397924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0506  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 519 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 214 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  36.73 
 
 		 901 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 956 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0520  transcriptional regulator, LuxR family  51.16 
 
 		 520 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.1412 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2396  transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 363 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000296074  decreased coverage  0.0001884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  42 
 
 		 919 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  41.3 
 
 		 903 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  41.3 
 
 		 903 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 259 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 299 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 201 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  41.51 
 
 		 214 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0027  DNA-binding transcriptional activator UhpA  37.93 
 
 		 197 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  33.85 
 
 		 550 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 222 aa  43.5  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3265  transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 298 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2089  two component LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.954326  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  41.51 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  44.83 
 
 		 597 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 211 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2127  transcriptional regulator, LuxR family  40.43 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 257 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 257 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.65 
 
 		 932 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.65 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 359 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0159  LuxR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 381 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655678 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 251 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 251 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0947  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 310 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00385235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0184  transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 507 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1577  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 340 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  36.84 
 
 		 257 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 242 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 372 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2177  response regulator receiver protein  48.15 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.430622  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 908 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0747  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 232 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.643618  normal  0.38139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4386  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 214 aa  42.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 269 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  41.3 
 
 		 262 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0757  LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2693  transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 280 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 267 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4518  two component LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 236 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 263 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 266 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0143  transcription regulator  40.68 
 
 		 265 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0072  transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 477 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.323936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 266 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 544 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 266 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  35.94 
 
 		 938 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 266 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2713  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 208 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 544 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4132  two-component system response regulator  41.67 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  41.3 
 
 		 904 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1980  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.893627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4080  transcriptional regulatory protein UhpA  41.67 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  40 
 
 		 921 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0621  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  41.38 
 
 		 824 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000506024  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>